Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUK7

Opn3, Opsin-3, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn3Q9WUK7 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Opn3Q9WUK7 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Opn3Q9WUK7 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Opn3Q9WUK7 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Opn3Q9WUK7 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Opn3Q9WUK7 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Opn3Q9WUK7 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Opn3Q9WUK7 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Opn3Q9WUK7 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Opn3Q9WUK7 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Opn3Q9WUK7 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Opn3Q9WUK7 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Opn3Q9WUK7 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Opn3Q9WUK7 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Opn3Q9WUK7 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Opn3Q9WUK7 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Opn3Q9WUK7 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Opn3Q9WUK7 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Opn3Q9WUK7 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Opn3Q9WUK7 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Opn3Q9WUK7 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Opn3Q9WUK7 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Opn3Q9WUK7 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Opn3Q9WUK7 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Opn3Q9WUK7 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Opn3Q9WUK7 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Opn3Q9WUK7 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Opn3Q9WUK7 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Opn3Q9WUK7 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Opn3Q9WUK7 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Opn3Q9WUK7 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Opn3Q9WUK7 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Opn3Q9WUK7 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Opn3Q9WUK7 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Opn3Q9WUK7 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Opn3Q9WUK7 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Opn3Q9WUK7 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Opn3Q9WUK7 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Opn3Q9WUK7 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Opn3Q9WUK7 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Opn3Q9WUK7 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Opn3Q9WUK7 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Opn3Q9WUK7 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Opn3Q9WUK7 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Opn3Q9WUK7 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Opn3Q9WUK7 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Opn3Q9WUK7 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Opn3Q9WUK7 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Opn3Q9WUK7 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Opn3Q9WUK7 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Opn3Q9WUK7 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Opn3Q9WUK7 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Opn3Q9WUK7 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Opn3Q9WUK7 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Opn3Q9WUK7 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Opn3Q9WUK7 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Opn3Q9WUK7 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Opn3Q9WUK7 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Opn3Q9WUK7 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Opn3Q9WUK7 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Opn3Q9WUK7 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Opn3Q9WUK7 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Opn3Q9WUK7 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Opn3Q9WUK7 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Opn3Q9WUK7 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Opn3Q9WUK7 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Opn3Q9WUK7 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Opn3Q9WUK7 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Opn3Q9WUK7 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Opn3Q9WUK7 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Opn3Q9WUK7 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Opn3Q9WUK7 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Opn3Q9WUK7 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Opn3Q9WUK7 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Opn3Q9WUK7 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Opn3Q9WUK7 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Opn3Q9WUK7 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Opn3Q9WUK7 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Opn3Q9WUK7 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Opn3Q9WUK7 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Opn3Q9WUK7 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Opn3Q9WUK7 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Opn3Q9WUK7 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Opn3Q9WUK7 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Opn3Q9WUK7 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Opn3Q9WUK7 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Opn3Q9WUK7 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Opn3Q9WUK7 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Opn3Q9WUK7 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Opn3Q9WUK7 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Opn3Q9WUK7 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Opn3Q9WUK7 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Opn3Q9WUK7 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Opn3Q9WUK7 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Opn3Q9WUK7 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Opn3Q9WUK7 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Opn3Q9WUK7 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Opn3Q9WUK7 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Opn3Q9WUK7 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Opn3Q9WUK7 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 197.2 ms