Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUB7

Clcnka, Chloride channel protein ClC-Ka, mousemouse

Predictions only

Length 687 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClcnkaQ9WUB7 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ClcnkaQ9WUB7 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ClcnkaQ9WUB7 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
ClcnkaQ9WUB7 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ClcnkaQ9WUB7 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ClcnkaQ9WUB7 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ClcnkaQ9WUB7 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ClcnkaQ9WUB7 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ClcnkaQ9WUB7 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ClcnkaQ9WUB7 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ClcnkaQ9WUB7 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ClcnkaQ9WUB7 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ClcnkaQ9WUB7 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
ClcnkaQ9WUB7 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ClcnkaQ9WUB7 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ClcnkaQ9WUB7 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ClcnkaQ9WUB7 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ClcnkaQ9WUB7 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ClcnkaQ9WUB7 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ClcnkaQ9WUB7 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ClcnkaQ9WUB7 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ClcnkaQ9WUB7 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ClcnkaQ9WUB7 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ClcnkaQ9WUB7 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ClcnkaQ9WUB7 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ClcnkaQ9WUB7 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ClcnkaQ9WUB7 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ClcnkaQ9WUB7 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ClcnkaQ9WUB7 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ClcnkaQ9WUB7 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
ClcnkaQ9WUB7 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ClcnkaQ9WUB7 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
ClcnkaQ9WUB7 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ClcnkaQ9WUB7 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ClcnkaQ9WUB7 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ClcnkaQ9WUB7 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ClcnkaQ9WUB7 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ClcnkaQ9WUB7 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ClcnkaQ9WUB7 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ClcnkaQ9WUB7 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ClcnkaQ9WUB7 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ClcnkaQ9WUB7 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ClcnkaQ9WUB7 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ClcnkaQ9WUB7 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ClcnkaQ9WUB7 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ClcnkaQ9WUB7 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ClcnkaQ9WUB7 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ClcnkaQ9WUB7 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ClcnkaQ9WUB7 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ClcnkaQ9WUB7 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ClcnkaQ9WUB7 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ClcnkaQ9WUB7 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
ClcnkaQ9WUB7 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ClcnkaQ9WUB7 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ClcnkaQ9WUB7 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ClcnkaQ9WUB7 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ClcnkaQ9WUB7 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ClcnkaQ9WUB7 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ClcnkaQ9WUB7 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
ClcnkaQ9WUB7 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ClcnkaQ9WUB7 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ClcnkaQ9WUB7 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ClcnkaQ9WUB7 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ClcnkaQ9WUB7 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ClcnkaQ9WUB7 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ClcnkaQ9WUB7 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ClcnkaQ9WUB7 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ClcnkaQ9WUB7 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ClcnkaQ9WUB7 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ClcnkaQ9WUB7 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ClcnkaQ9WUB7 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ClcnkaQ9WUB7 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ClcnkaQ9WUB7 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ClcnkaQ9WUB7 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ClcnkaQ9WUB7 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ClcnkaQ9WUB7 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ClcnkaQ9WUB7 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ClcnkaQ9WUB7 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ClcnkaQ9WUB7 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ClcnkaQ9WUB7 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ClcnkaQ9WUB7 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ClcnkaQ9WUB7 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ClcnkaQ9WUB7 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ClcnkaQ9WUB7 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ClcnkaQ9WUB7 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ClcnkaQ9WUB7 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ClcnkaQ9WUB7 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ClcnkaQ9WUB7 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ClcnkaQ9WUB7 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ClcnkaQ9WUB7 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ClcnkaQ9WUB7 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ClcnkaQ9WUB7 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ClcnkaQ9WUB7 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ClcnkaQ9WUB7 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ClcnkaQ9WUB7 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ClcnkaQ9WUB7 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ClcnkaQ9WUB7 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ClcnkaQ9WUB7 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ClcnkaQ9WUB7 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ClcnkaQ9WUB7 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 500 ms