Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUB6

Clcnkb, Chloride channel protein ClC-Kb, mousemouse

Predictions only

Length 687 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClcnkbQ9WUB6 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ClcnkbQ9WUB6 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ClcnkbQ9WUB6 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ClcnkbQ9WUB6 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ClcnkbQ9WUB6 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
ClcnkbQ9WUB6 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
ClcnkbQ9WUB6 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ClcnkbQ9WUB6 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ClcnkbQ9WUB6 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ClcnkbQ9WUB6 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ClcnkbQ9WUB6 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ClcnkbQ9WUB6 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ClcnkbQ9WUB6 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ClcnkbQ9WUB6 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ClcnkbQ9WUB6 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ClcnkbQ9WUB6 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ClcnkbQ9WUB6 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ClcnkbQ9WUB6 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ClcnkbQ9WUB6 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ClcnkbQ9WUB6 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ClcnkbQ9WUB6 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
ClcnkbQ9WUB6 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ClcnkbQ9WUB6 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ClcnkbQ9WUB6 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
ClcnkbQ9WUB6 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ClcnkbQ9WUB6 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ClcnkbQ9WUB6 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ClcnkbQ9WUB6 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ClcnkbQ9WUB6 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ClcnkbQ9WUB6 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ClcnkbQ9WUB6 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ClcnkbQ9WUB6 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ClcnkbQ9WUB6 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ClcnkbQ9WUB6 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ClcnkbQ9WUB6 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ClcnkbQ9WUB6 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
ClcnkbQ9WUB6 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ClcnkbQ9WUB6 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ClcnkbQ9WUB6 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
ClcnkbQ9WUB6 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ClcnkbQ9WUB6 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ClcnkbQ9WUB6 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ClcnkbQ9WUB6 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ClcnkbQ9WUB6 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ClcnkbQ9WUB6 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
ClcnkbQ9WUB6 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ClcnkbQ9WUB6 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ClcnkbQ9WUB6 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ClcnkbQ9WUB6 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ClcnkbQ9WUB6 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ClcnkbQ9WUB6 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ClcnkbQ9WUB6 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ClcnkbQ9WUB6 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ClcnkbQ9WUB6 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ClcnkbQ9WUB6 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ClcnkbQ9WUB6 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ClcnkbQ9WUB6 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ClcnkbQ9WUB6 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ClcnkbQ9WUB6 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ClcnkbQ9WUB6 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ClcnkbQ9WUB6 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ClcnkbQ9WUB6 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ClcnkbQ9WUB6 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ClcnkbQ9WUB6 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ClcnkbQ9WUB6 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ClcnkbQ9WUB6 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ClcnkbQ9WUB6 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ClcnkbQ9WUB6 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ClcnkbQ9WUB6 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
ClcnkbQ9WUB6 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ClcnkbQ9WUB6 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ClcnkbQ9WUB6 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ClcnkbQ9WUB6 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ClcnkbQ9WUB6 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
ClcnkbQ9WUB6 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ClcnkbQ9WUB6 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ClcnkbQ9WUB6 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ClcnkbQ9WUB6 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ClcnkbQ9WUB6 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ClcnkbQ9WUB6 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ClcnkbQ9WUB6 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ClcnkbQ9WUB6 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
ClcnkbQ9WUB6 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ClcnkbQ9WUB6 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ClcnkbQ9WUB6 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ClcnkbQ9WUB6 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ClcnkbQ9WUB6 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ClcnkbQ9WUB6 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ClcnkbQ9WUB6 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ClcnkbQ9WUB6 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ClcnkbQ9WUB6 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ClcnkbQ9WUB6 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ClcnkbQ9WUB6 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ClcnkbQ9WUB6 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ClcnkbQ9WUB6 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ClcnkbQ9WUB6 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ClcnkbQ9WUB6 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ClcnkbQ9WUB6 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ClcnkbQ9WUB6 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
ClcnkbQ9WUB6 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms