Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTU3

Scn8a, Sodium channel protein type 8 subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,978 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn8aQ9WTU3 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26,29■■□□□ 1,8
Scn8aQ9WTU3 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,29■■□□□ 1,8
Scn8aQ9WTU3 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,28■■□□□ 1,8
Scn8aQ9WTU3 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC26,28■■□□□ 1,8
Scn8aQ9WTU3 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,28■■□□□ 1,8
Scn8aQ9WTU3 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC26,26■■□□□ 1,79
Scn8aQ9WTU3 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC26,26■■□□□ 1,79
Scn8aQ9WTU3 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,24■■□□□ 1,79
Scn8aQ9WTU3 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC26,24■■□□□ 1,79
Scn8aQ9WTU3 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC26,24■■□□□ 1,79
Scn8aQ9WTU3 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,24■■□□□ 1,79
Scn8aQ9WTU3 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC26,24■■□□□ 1,79
Scn8aQ9WTU3 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC26,23■■□□□ 1,79
Scn8aQ9WTU3 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,22■■□□□ 1,79
Scn8aQ9WTU3 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,2■■□□□ 1,78
Scn8aQ9WTU3 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC26,19■■□□□ 1,78
Scn8aQ9WTU3 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26,19■■□□□ 1,78
Scn8aQ9WTU3 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC26,18■■□□□ 1,78
Scn8aQ9WTU3 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC26,17■■□□□ 1,78
Scn8aQ9WTU3 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,17■■□□□ 1,78
Scn8aQ9WTU3 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,16■■□□□ 1,78
Scn8aQ9WTU3 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,16■■□□□ 1,78
Scn8aQ9WTU3 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26,16■■□□□ 1,78
Scn8aQ9WTU3 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC26,15■■□□□ 1,78
Scn8aQ9WTU3 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,14■■□□□ 1,78
Scn8aQ9WTU3 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC26,13■■□□□ 1,77
Scn8aQ9WTU3 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,13■■□□□ 1,77
Scn8aQ9WTU3 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26,11■■□□□ 1,77
Scn8aQ9WTU3 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26,1■■□□□ 1,77
Scn8aQ9WTU3 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26,09■■□□□ 1,77
Scn8aQ9WTU3 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,08■■□□□ 1,77
Scn8aQ9WTU3 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26,08■■□□□ 1,76
Scn8aQ9WTU3 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC26,07■■□□□ 1,76
Scn8aQ9WTU3 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC26,07■■□□□ 1,76
Scn8aQ9WTU3 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC26,07■■□□□ 1,76
Scn8aQ9WTU3 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,07■■□□□ 1,76
Scn8aQ9WTU3 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26,06■■□□□ 1,76
Scn8aQ9WTU3 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC26,06■■□□□ 1,76
Scn8aQ9WTU3 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,06■■□□□ 1,76
Scn8aQ9WTU3 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC26,06■■□□□ 1,76
Scn8aQ9WTU3 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC26,06■■□□□ 1,76
Scn8aQ9WTU3 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,05■■□□□ 1,76
Scn8aQ9WTU3 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,05■■□□□ 1,76
Scn8aQ9WTU3 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,05■■□□□ 1,76
Scn8aQ9WTU3 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,05■■□□□ 1,76
Scn8aQ9WTU3 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC26,04■■□□□ 1,76
Scn8aQ9WTU3 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,03■■□□□ 1,76
Scn8aQ9WTU3 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,02■■□□□ 1,76
Scn8aQ9WTU3 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,01■■□□□ 1,75
Scn8aQ9WTU3 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,01■■□□□ 1,75
Scn8aQ9WTU3 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1,75
Scn8aQ9WTU3 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,99■■□□□ 1,75
Scn8aQ9WTU3 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,99■■□□□ 1,75
Scn8aQ9WTU3 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25,98■■□□□ 1,75
Scn8aQ9WTU3 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,98■■□□□ 1,75
Scn8aQ9WTU3 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25,97■■□□□ 1,75
Scn8aQ9WTU3 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC25,97■■□□□ 1,75
Scn8aQ9WTU3 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,96■■□□□ 1,75
Scn8aQ9WTU3 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25,96■■□□□ 1,75
Scn8aQ9WTU3 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC25,96■■□□□ 1,75
Scn8aQ9WTU3 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25,95■■□□□ 1,75
Scn8aQ9WTU3 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,94■■□□□ 1,74
Scn8aQ9WTU3 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,94■■□□□ 1,74
Scn8aQ9WTU3 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC25,94■■□□□ 1,74
Scn8aQ9WTU3 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC25,94■■□□□ 1,74
Scn8aQ9WTU3 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25,93■■□□□ 1,74
Scn8aQ9WTU3 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC25,93■■□□□ 1,74
Scn8aQ9WTU3 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25,92■■□□□ 1,74
Scn8aQ9WTU3 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,92■■□□□ 1,74
Scn8aQ9WTU3 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25,91■■□□□ 1,74
Scn8aQ9WTU3 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,9■■□□□ 1,74
Scn8aQ9WTU3 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,9■■□□□ 1,74
Scn8aQ9WTU3 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,9■■□□□ 1,74
Scn8aQ9WTU3 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25,89■■□□□ 1,73
Scn8aQ9WTU3 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,89■■□□□ 1,73
Scn8aQ9WTU3 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25,87■■□□□ 1,73
Scn8aQ9WTU3 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,86■■□□□ 1,73
Scn8aQ9WTU3 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25,86■■□□□ 1,73
Scn8aQ9WTU3 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25,86■■□□□ 1,73
Scn8aQ9WTU3 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,85■■□□□ 1,73
Scn8aQ9WTU3 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,85■■□□□ 1,73
Scn8aQ9WTU3 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,85■■□□□ 1,73
Scn8aQ9WTU3 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,84■■□□□ 1,73
Scn8aQ9WTU3 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,84■■□□□ 1,73
Scn8aQ9WTU3 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,82■■□□□ 1,72
Scn8aQ9WTU3 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25,82■■□□□ 1,72
Scn8aQ9WTU3 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,81■■□□□ 1,72
Scn8aQ9WTU3 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC25,81■■□□□ 1,72
Scn8aQ9WTU3 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25,8■■□□□ 1,72
Scn8aQ9WTU3 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25,8■■□□□ 1,72
Scn8aQ9WTU3 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25,8■■□□□ 1,72
Scn8aQ9WTU3 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25,8■■□□□ 1,72
Scn8aQ9WTU3 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,8■■□□□ 1,72
Scn8aQ9WTU3 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,78■■□□□ 1,72
Scn8aQ9WTU3 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,78■■□□□ 1,72
Scn8aQ9WTU3 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25,78■■□□□ 1,72
Scn8aQ9WTU3 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,77■■□□□ 1,72
Scn8aQ9WTU3 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,76■■□□□ 1,71
Scn8aQ9WTU3 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,75■■□□□ 1,71
Scn8aQ9WTU3 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,75■■□□□ 1,71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12,4 ms