Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTK8

Spo11, Meiotic recombination protein SPO11, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spo11Q9WTK8 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Spo11Q9WTK8 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Spo11Q9WTK8 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Spo11Q9WTK8 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Spo11Q9WTK8 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Spo11Q9WTK8 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Spo11Q9WTK8 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Spo11Q9WTK8 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Spo11Q9WTK8 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Spo11Q9WTK8 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Spo11Q9WTK8 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Spo11Q9WTK8 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Spo11Q9WTK8 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Spo11Q9WTK8 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Spo11Q9WTK8 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Spo11Q9WTK8 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Spo11Q9WTK8 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Spo11Q9WTK8 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Spo11Q9WTK8 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Spo11Q9WTK8 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Spo11Q9WTK8 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Spo11Q9WTK8 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Spo11Q9WTK8 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Spo11Q9WTK8 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Spo11Q9WTK8 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Spo11Q9WTK8 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Spo11Q9WTK8 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Spo11Q9WTK8 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Spo11Q9WTK8 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Spo11Q9WTK8 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Spo11Q9WTK8 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Spo11Q9WTK8 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Spo11Q9WTK8 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Spo11Q9WTK8 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Spo11Q9WTK8 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Spo11Q9WTK8 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Spo11Q9WTK8 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Spo11Q9WTK8 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Spo11Q9WTK8 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Spo11Q9WTK8 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Spo11Q9WTK8 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Spo11Q9WTK8 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Spo11Q9WTK8 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Spo11Q9WTK8 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Spo11Q9WTK8 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Spo11Q9WTK8 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Spo11Q9WTK8 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Spo11Q9WTK8 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Spo11Q9WTK8 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Spo11Q9WTK8 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Spo11Q9WTK8 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Spo11Q9WTK8 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Spo11Q9WTK8 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Spo11Q9WTK8 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Spo11Q9WTK8 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Spo11Q9WTK8 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Spo11Q9WTK8 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Spo11Q9WTK8 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Spo11Q9WTK8 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Spo11Q9WTK8 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Spo11Q9WTK8 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Spo11Q9WTK8 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Spo11Q9WTK8 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Spo11Q9WTK8 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Spo11Q9WTK8 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Spo11Q9WTK8 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Spo11Q9WTK8 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Spo11Q9WTK8 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Spo11Q9WTK8 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Spo11Q9WTK8 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Spo11Q9WTK8 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Spo11Q9WTK8 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Spo11Q9WTK8 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Spo11Q9WTK8 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Spo11Q9WTK8 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Spo11Q9WTK8 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Spo11Q9WTK8 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Spo11Q9WTK8 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Spo11Q9WTK8 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Spo11Q9WTK8 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Spo11Q9WTK8 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Spo11Q9WTK8 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Spo11Q9WTK8 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Spo11Q9WTK8 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Spo11Q9WTK8 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Spo11Q9WTK8 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Spo11Q9WTK8 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Spo11Q9WTK8 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Spo11Q9WTK8 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Spo11Q9WTK8 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Spo11Q9WTK8 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Spo11Q9WTK8 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Spo11Q9WTK8 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Spo11Q9WTK8 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Spo11Q9WTK8 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Spo11Q9WTK8 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Spo11Q9WTK8 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Spo11Q9WTK8 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Spo11Q9WTK8 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Spo11Q9WTK8 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.5 ms