Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1Z8

Sorbs3, Vinexin, mousemouse

Predictions only

Length 733 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sorbs3Q9R1Z8 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Sorbs3Q9R1Z8 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Sorbs3Q9R1Z8 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Sorbs3Q9R1Z8 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Sorbs3Q9R1Z8 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Sorbs3Q9R1Z8 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
Sorbs3Q9R1Z8 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Sorbs3Q9R1Z8 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Sorbs3Q9R1Z8 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Sorbs3Q9R1Z8 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Sorbs3Q9R1Z8 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Sorbs3Q9R1Z8 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Sorbs3Q9R1Z8 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Sorbs3Q9R1Z8 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Sorbs3Q9R1Z8 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Sorbs3Q9R1Z8 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Sorbs3Q9R1Z8 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Sorbs3Q9R1Z8 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
Sorbs3Q9R1Z8 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Sorbs3Q9R1Z8 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Sorbs3Q9R1Z8 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Sorbs3Q9R1Z8 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Sorbs3Q9R1Z8 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Sorbs3Q9R1Z8 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Sorbs3Q9R1Z8 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Sorbs3Q9R1Z8 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Sorbs3Q9R1Z8 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Sorbs3Q9R1Z8 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Sorbs3Q9R1Z8 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Sorbs3Q9R1Z8 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Sorbs3Q9R1Z8 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Sorbs3Q9R1Z8 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Sorbs3Q9R1Z8 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Sorbs3Q9R1Z8 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Sorbs3Q9R1Z8 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Sorbs3Q9R1Z8 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Sorbs3Q9R1Z8 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Sorbs3Q9R1Z8 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Sorbs3Q9R1Z8 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Sorbs3Q9R1Z8 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
Sorbs3Q9R1Z8 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
Sorbs3Q9R1Z8 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Sorbs3Q9R1Z8 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Sorbs3Q9R1Z8 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Sorbs3Q9R1Z8 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Sorbs3Q9R1Z8 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Sorbs3Q9R1Z8 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Sorbs3Q9R1Z8 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Sorbs3Q9R1Z8 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Sorbs3Q9R1Z8 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Sorbs3Q9R1Z8 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Sorbs3Q9R1Z8 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Sorbs3Q9R1Z8 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Sorbs3Q9R1Z8 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Sorbs3Q9R1Z8 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Sorbs3Q9R1Z8 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Sorbs3Q9R1Z8 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Sorbs3Q9R1Z8 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Sorbs3Q9R1Z8 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Sorbs3Q9R1Z8 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Sorbs3Q9R1Z8 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Sorbs3Q9R1Z8 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Sorbs3Q9R1Z8 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Sorbs3Q9R1Z8 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Sorbs3Q9R1Z8 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Sorbs3Q9R1Z8 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Sorbs3Q9R1Z8 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Sorbs3Q9R1Z8 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Sorbs3Q9R1Z8 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Sorbs3Q9R1Z8 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Sorbs3Q9R1Z8 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Sorbs3Q9R1Z8 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Sorbs3Q9R1Z8 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Sorbs3Q9R1Z8 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Sorbs3Q9R1Z8 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Sorbs3Q9R1Z8 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Sorbs3Q9R1Z8 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Sorbs3Q9R1Z8 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Sorbs3Q9R1Z8 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Sorbs3Q9R1Z8 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Sorbs3Q9R1Z8 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Sorbs3Q9R1Z8 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Sorbs3Q9R1Z8 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Sorbs3Q9R1Z8 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Sorbs3Q9R1Z8 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Sorbs3Q9R1Z8 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Sorbs3Q9R1Z8 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Sorbs3Q9R1Z8 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Sorbs3Q9R1Z8 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Sorbs3Q9R1Z8 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Sorbs3Q9R1Z8 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Sorbs3Q9R1Z8 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Sorbs3Q9R1Z8 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Sorbs3Q9R1Z8 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Sorbs3Q9R1Z8 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Sorbs3Q9R1Z8 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Sorbs3Q9R1Z8 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Sorbs3Q9R1Z8 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Sorbs3Q9R1Z8 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Sorbs3Q9R1Z8 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms