Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0L9

Cd164, Sialomucin core protein 24, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd164Q9R0L9 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd164Q9R0L9 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd164Q9R0L9 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd164Q9R0L9 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd164Q9R0L9 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd164Q9R0L9 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd164Q9R0L9 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd164Q9R0L9 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd164Q9R0L9 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd164Q9R0L9 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd164Q9R0L9 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd164Q9R0L9 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd164Q9R0L9 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd164Q9R0L9 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd164Q9R0L9 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd164Q9R0L9 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd164Q9R0L9 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd164Q9R0L9 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd164Q9R0L9 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd164Q9R0L9 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd164Q9R0L9 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd164Q9R0L9 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd164Q9R0L9 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cd164Q9R0L9 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd164Q9R0L9 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd164Q9R0L9 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd164Q9R0L9 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cd164Q9R0L9 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd164Q9R0L9 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd164Q9R0L9 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cd164Q9R0L9 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cd164Q9R0L9 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cd164Q9R0L9 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cd164Q9R0L9 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cd164Q9R0L9 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cd164Q9R0L9 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cd164Q9R0L9 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cd164Q9R0L9 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cd164Q9R0L9 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cd164Q9R0L9 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cd164Q9R0L9 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd164Q9R0L9 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd164Q9R0L9 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd164Q9R0L9 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd164Q9R0L9 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd164Q9R0L9 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd164Q9R0L9 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd164Q9R0L9 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd164Q9R0L9 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd164Q9R0L9 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd164Q9R0L9 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd164Q9R0L9 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd164Q9R0L9 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd164Q9R0L9 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd164Q9R0L9 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd164Q9R0L9 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd164Q9R0L9 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd164Q9R0L9 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd164Q9R0L9 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd164Q9R0L9 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd164Q9R0L9 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd164Q9R0L9 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd164Q9R0L9 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd164Q9R0L9 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd164Q9R0L9 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd164Q9R0L9 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd164Q9R0L9 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd164Q9R0L9 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd164Q9R0L9 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd164Q9R0L9 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd164Q9R0L9 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd164Q9R0L9 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd164Q9R0L9 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd164Q9R0L9 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd164Q9R0L9 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd164Q9R0L9 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd164Q9R0L9 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd164Q9R0L9 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd164Q9R0L9 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd164Q9R0L9 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd164Q9R0L9 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd164Q9R0L9 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd164Q9R0L9 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd164Q9R0L9 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cd164Q9R0L9 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cd164Q9R0L9 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cd164Q9R0L9 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cd164Q9R0L9 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cd164Q9R0L9 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cd164Q9R0L9 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cd164Q9R0L9 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cd164Q9R0L9 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cd164Q9R0L9 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cd164Q9R0L9 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cd164Q9R0L9 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cd164Q9R0L9 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Cd164Q9R0L9 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Cd164Q9R0L9 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cd164Q9R0L9 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cd164Q9R0L9 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8 ms