Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS3

Numb, Protein numb homolog, mousemouse

Predictions only

Length 653 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NumbQ9QZS3 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NumbQ9QZS3 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NumbQ9QZS3 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NumbQ9QZS3 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NumbQ9QZS3 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NumbQ9QZS3 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NumbQ9QZS3 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
NumbQ9QZS3 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NumbQ9QZS3 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NumbQ9QZS3 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NumbQ9QZS3 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NumbQ9QZS3 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NumbQ9QZS3 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NumbQ9QZS3 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NumbQ9QZS3 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
NumbQ9QZS3 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NumbQ9QZS3 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NumbQ9QZS3 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NumbQ9QZS3 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NumbQ9QZS3 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NumbQ9QZS3 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NumbQ9QZS3 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NumbQ9QZS3 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NumbQ9QZS3 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NumbQ9QZS3 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
NumbQ9QZS3 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
NumbQ9QZS3 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NumbQ9QZS3 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NumbQ9QZS3 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NumbQ9QZS3 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NumbQ9QZS3 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NumbQ9QZS3 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NumbQ9QZS3 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NumbQ9QZS3 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NumbQ9QZS3 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NumbQ9QZS3 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NumbQ9QZS3 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NumbQ9QZS3 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NumbQ9QZS3 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NumbQ9QZS3 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NumbQ9QZS3 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NumbQ9QZS3 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NumbQ9QZS3 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NumbQ9QZS3 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NumbQ9QZS3 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
NumbQ9QZS3 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NumbQ9QZS3 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NumbQ9QZS3 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NumbQ9QZS3 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NumbQ9QZS3 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NumbQ9QZS3 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NumbQ9QZS3 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NumbQ9QZS3 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NumbQ9QZS3 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NumbQ9QZS3 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NumbQ9QZS3 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NumbQ9QZS3 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NumbQ9QZS3 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
NumbQ9QZS3 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NumbQ9QZS3 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
NumbQ9QZS3 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NumbQ9QZS3 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NumbQ9QZS3 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NumbQ9QZS3 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NumbQ9QZS3 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NumbQ9QZS3 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NumbQ9QZS3 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NumbQ9QZS3 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NumbQ9QZS3 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NumbQ9QZS3 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
NumbQ9QZS3 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NumbQ9QZS3 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NumbQ9QZS3 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
NumbQ9QZS3 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NumbQ9QZS3 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NumbQ9QZS3 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NumbQ9QZS3 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NumbQ9QZS3 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
NumbQ9QZS3 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NumbQ9QZS3 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NumbQ9QZS3 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NumbQ9QZS3 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NumbQ9QZS3 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NumbQ9QZS3 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
NumbQ9QZS3 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
NumbQ9QZS3 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
NumbQ9QZS3 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NumbQ9QZS3 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NumbQ9QZS3 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
NumbQ9QZS3 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NumbQ9QZS3 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NumbQ9QZS3 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NumbQ9QZS3 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NumbQ9QZS3 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NumbQ9QZS3 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
NumbQ9QZS3 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NumbQ9QZS3 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NumbQ9QZS3 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NumbQ9QZS3 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NumbQ9QZS3 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 134.1 ms