Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZM4

Tnfrsf10b, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 10B, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
Tnfrsf10bQ9QZM4 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Tnfrsf10bQ9QZM4 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Tnfrsf10bQ9QZM4 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Tnfrsf10bQ9QZM4 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Tnfrsf10bQ9QZM4 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Tnfrsf10bQ9QZM4 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Tnfrsf10bQ9QZM4 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Tnfrsf10bQ9QZM4 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Tnfrsf10bQ9QZM4 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Tnfrsf10bQ9QZM4 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Tnfrsf10bQ9QZM4 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Tnfrsf10bQ9QZM4 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Tnfrsf10bQ9QZM4 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Tnfrsf10bQ9QZM4 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Tnfrsf10bQ9QZM4 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Tnfrsf10bQ9QZM4 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Tnfrsf10bQ9QZM4 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Tnfrsf10bQ9QZM4 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Tnfrsf10bQ9QZM4 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Tnfrsf10bQ9QZM4 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Tnfrsf10bQ9QZM4 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Tnfrsf10bQ9QZM4 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Tnfrsf10bQ9QZM4 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Tnfrsf10bQ9QZM4 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Tnfrsf10bQ9QZM4 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Tnfrsf10bQ9QZM4 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Tnfrsf10bQ9QZM4 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Tnfrsf10bQ9QZM4 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Tnfrsf10bQ9QZM4 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Tnfrsf10bQ9QZM4 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Tnfrsf10bQ9QZM4 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Tnfrsf10bQ9QZM4 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Tnfrsf10bQ9QZM4 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Tnfrsf10bQ9QZM4 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Tnfrsf10bQ9QZM4 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Tnfrsf10bQ9QZM4 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Tnfrsf10bQ9QZM4 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Tnfrsf10bQ9QZM4 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Tnfrsf10bQ9QZM4 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Tnfrsf10bQ9QZM4 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Tnfrsf10bQ9QZM4 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Tnfrsf10bQ9QZM4 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Tnfrsf10bQ9QZM4 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Tnfrsf10bQ9QZM4 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Tnfrsf10bQ9QZM4 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Tnfrsf10bQ9QZM4 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Tnfrsf10bQ9QZM4 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
Tnfrsf10bQ9QZM4 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Tnfrsf10bQ9QZM4 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Tnfrsf10bQ9QZM4 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms