Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZF2

Gpc1, Glypican-1, mousemouse

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Length 557 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc1Q9QZF2 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Gpc1Q9QZF2 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Gpc1Q9QZF2 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Gpc1Q9QZF2 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Gpc1Q9QZF2 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Gpc1Q9QZF2 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gpc1Q9QZF2 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gpc1Q9QZF2 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Gpc1Q9QZF2 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gpc1Q9QZF2 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gpc1Q9QZF2 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Gpc1Q9QZF2 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Gpc1Q9QZF2 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Gpc1Q9QZF2 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Gpc1Q9QZF2 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gpc1Q9QZF2 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gpc1Q9QZF2 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gpc1Q9QZF2 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Gpc1Q9QZF2 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Gpc1Q9QZF2 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Gpc1Q9QZF2 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Gpc1Q9QZF2 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gpc1Q9QZF2 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gpc1Q9QZF2 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gpc1Q9QZF2 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gpc1Q9QZF2 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Gpc1Q9QZF2 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Gpc1Q9QZF2 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Gpc1Q9QZF2 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gpc1Q9QZF2 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gpc1Q9QZF2 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Gpc1Q9QZF2 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Gpc1Q9QZF2 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Gpc1Q9QZF2 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Gpc1Q9QZF2 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gpc1Q9QZF2 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gpc1Q9QZF2 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gpc1Q9QZF2 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gpc1Q9QZF2 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gpc1Q9QZF2 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Gpc1Q9QZF2 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Gpc1Q9QZF2 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Gpc1Q9QZF2 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Gpc1Q9QZF2 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Gpc1Q9QZF2 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Gpc1Q9QZF2 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Gpc1Q9QZF2 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gpc1Q9QZF2 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gpc1Q9QZF2 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gpc1Q9QZF2 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gpc1Q9QZF2 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Gpc1Q9QZF2 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Gpc1Q9QZF2 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Gpc1Q9QZF2 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gpc1Q9QZF2 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gpc1Q9QZF2 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gpc1Q9QZF2 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Gpc1Q9QZF2 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gpc1Q9QZF2 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gpc1Q9QZF2 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Gpc1Q9QZF2 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Gpc1Q9QZF2 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Gpc1Q9QZF2 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Gpc1Q9QZF2 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Gpc1Q9QZF2 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gpc1Q9QZF2 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gpc1Q9QZF2 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gpc1Q9QZF2 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gpc1Q9QZF2 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gpc1Q9QZF2 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gpc1Q9QZF2 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Gpc1Q9QZF2 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Gpc1Q9QZF2 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gpc1Q9QZF2 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gpc1Q9QZF2 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gpc1Q9QZF2 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gpc1Q9QZF2 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gpc1Q9QZF2 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gpc1Q9QZF2 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Gpc1Q9QZF2 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Gpc1Q9QZF2 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Gpc1Q9QZF2 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gpc1Q9QZF2 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gpc1Q9QZF2 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gpc1Q9QZF2 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gpc1Q9QZF2 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gpc1Q9QZF2 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gpc1Q9QZF2 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gpc1Q9QZF2 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gpc1Q9QZF2 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gpc1Q9QZF2 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Gpc1Q9QZF2 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Gpc1Q9QZF2 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Gpc1Q9QZF2 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gpc1Q9QZF2 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gpc1Q9QZF2 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gpc1Q9QZF2 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gpc1Q9QZF2 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Gpc1Q9QZF2 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gpc1Q9QZF2 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
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