Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ25

Vnn3, Vascular non-inflammatory molecule 3, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vnn3Q9QZ25 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Vnn3Q9QZ25 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Vnn3Q9QZ25 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Vnn3Q9QZ25 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Vnn3Q9QZ25 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Vnn3Q9QZ25 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Vnn3Q9QZ25 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Vnn3Q9QZ25 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Vnn3Q9QZ25 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Vnn3Q9QZ25 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Vnn3Q9QZ25 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Vnn3Q9QZ25 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Vnn3Q9QZ25 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Vnn3Q9QZ25 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Vnn3Q9QZ25 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Vnn3Q9QZ25 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Vnn3Q9QZ25 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Vnn3Q9QZ25 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Vnn3Q9QZ25 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Vnn3Q9QZ25 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Vnn3Q9QZ25 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Vnn3Q9QZ25 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Vnn3Q9QZ25 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Vnn3Q9QZ25 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Vnn3Q9QZ25 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Vnn3Q9QZ25 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Vnn3Q9QZ25 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Vnn3Q9QZ25 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Vnn3Q9QZ25 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Vnn3Q9QZ25 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Vnn3Q9QZ25 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Vnn3Q9QZ25 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Vnn3Q9QZ25 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Vnn3Q9QZ25 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Vnn3Q9QZ25 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Vnn3Q9QZ25 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Vnn3Q9QZ25 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Vnn3Q9QZ25 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Vnn3Q9QZ25 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Vnn3Q9QZ25 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Vnn3Q9QZ25 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Vnn3Q9QZ25 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Vnn3Q9QZ25 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Vnn3Q9QZ25 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Vnn3Q9QZ25 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Vnn3Q9QZ25 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Vnn3Q9QZ25 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Vnn3Q9QZ25 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Vnn3Q9QZ25 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Vnn3Q9QZ25 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Vnn3Q9QZ25 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Vnn3Q9QZ25 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Vnn3Q9QZ25 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Vnn3Q9QZ25 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Vnn3Q9QZ25 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Vnn3Q9QZ25 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Vnn3Q9QZ25 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Vnn3Q9QZ25 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Vnn3Q9QZ25 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Vnn3Q9QZ25 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Vnn3Q9QZ25 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Vnn3Q9QZ25 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Vnn3Q9QZ25 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Vnn3Q9QZ25 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Vnn3Q9QZ25 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Vnn3Q9QZ25 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Vnn3Q9QZ25 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Vnn3Q9QZ25 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Vnn3Q9QZ25 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Vnn3Q9QZ25 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Vnn3Q9QZ25 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Vnn3Q9QZ25 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Vnn3Q9QZ25 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Vnn3Q9QZ25 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Vnn3Q9QZ25 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Vnn3Q9QZ25 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Vnn3Q9QZ25 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Vnn3Q9QZ25 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Vnn3Q9QZ25 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Vnn3Q9QZ25 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Vnn3Q9QZ25 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Vnn3Q9QZ25 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Vnn3Q9QZ25 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Vnn3Q9QZ25 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Vnn3Q9QZ25 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Vnn3Q9QZ25 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Vnn3Q9QZ25 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Vnn3Q9QZ25 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Vnn3Q9QZ25 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Vnn3Q9QZ25 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Vnn3Q9QZ25 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Vnn3Q9QZ25 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Vnn3Q9QZ25 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Vnn3Q9QZ25 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Vnn3Q9QZ25 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Vnn3Q9QZ25 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Vnn3Q9QZ25 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Vnn3Q9QZ25 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Vnn3Q9QZ25 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Vnn3Q9QZ25 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms