Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ25

Vnn3, Vascular non-inflammatory molecule 3, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vnn3Q9QZ25 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Vnn3Q9QZ25 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Vnn3Q9QZ25 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Vnn3Q9QZ25 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Vnn3Q9QZ25 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Vnn3Q9QZ25 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Vnn3Q9QZ25 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Vnn3Q9QZ25 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Vnn3Q9QZ25 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Vnn3Q9QZ25 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Vnn3Q9QZ25 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Vnn3Q9QZ25 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Vnn3Q9QZ25 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Vnn3Q9QZ25 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Vnn3Q9QZ25 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Vnn3Q9QZ25 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Vnn3Q9QZ25 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Vnn3Q9QZ25 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Vnn3Q9QZ25 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Vnn3Q9QZ25 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Vnn3Q9QZ25 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Vnn3Q9QZ25 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Vnn3Q9QZ25 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Vnn3Q9QZ25 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Vnn3Q9QZ25 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Vnn3Q9QZ25 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Vnn3Q9QZ25 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Vnn3Q9QZ25 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Vnn3Q9QZ25 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Vnn3Q9QZ25 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Vnn3Q9QZ25 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Vnn3Q9QZ25 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Vnn3Q9QZ25 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Vnn3Q9QZ25 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Vnn3Q9QZ25 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Vnn3Q9QZ25 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Vnn3Q9QZ25 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Vnn3Q9QZ25 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Vnn3Q9QZ25 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Vnn3Q9QZ25 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Vnn3Q9QZ25 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Vnn3Q9QZ25 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Vnn3Q9QZ25 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Vnn3Q9QZ25 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Vnn3Q9QZ25 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Vnn3Q9QZ25 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Vnn3Q9QZ25 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Vnn3Q9QZ25 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Vnn3Q9QZ25 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Vnn3Q9QZ25 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Vnn3Q9QZ25 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Vnn3Q9QZ25 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Vnn3Q9QZ25 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Vnn3Q9QZ25 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Vnn3Q9QZ25 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Vnn3Q9QZ25 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Vnn3Q9QZ25 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Vnn3Q9QZ25 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Vnn3Q9QZ25 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Vnn3Q9QZ25 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Vnn3Q9QZ25 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Vnn3Q9QZ25 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Vnn3Q9QZ25 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Vnn3Q9QZ25 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Vnn3Q9QZ25 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Vnn3Q9QZ25 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Vnn3Q9QZ25 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Vnn3Q9QZ25 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Vnn3Q9QZ25 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Vnn3Q9QZ25 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Vnn3Q9QZ25 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Vnn3Q9QZ25 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Vnn3Q9QZ25 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Vnn3Q9QZ25 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Vnn3Q9QZ25 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Vnn3Q9QZ25 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Vnn3Q9QZ25 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Vnn3Q9QZ25 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Vnn3Q9QZ25 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Vnn3Q9QZ25 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Vnn3Q9QZ25 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Vnn3Q9QZ25 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Vnn3Q9QZ25 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Vnn3Q9QZ25 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Vnn3Q9QZ25 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Vnn3Q9QZ25 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Vnn3Q9QZ25 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Vnn3Q9QZ25 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Vnn3Q9QZ25 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Vnn3Q9QZ25 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Vnn3Q9QZ25 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Vnn3Q9QZ25 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Vnn3Q9QZ25 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Vnn3Q9QZ25 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Vnn3Q9QZ25 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Vnn3Q9QZ25 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Vnn3Q9QZ25 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Vnn3Q9QZ25 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Vnn3Q9QZ25 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Vnn3Q9QZ25 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99.4 ms