Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ15

Clec4a, C-type lectin domain family 4 member A, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec4aQ9QZ15 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Clec4aQ9QZ15 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Clec4aQ9QZ15 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Clec4aQ9QZ15 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Clec4aQ9QZ15 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Clec4aQ9QZ15 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Clec4aQ9QZ15 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Clec4aQ9QZ15 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Clec4aQ9QZ15 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Clec4aQ9QZ15 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Clec4aQ9QZ15 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Clec4aQ9QZ15 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Clec4aQ9QZ15 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Clec4aQ9QZ15 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Clec4aQ9QZ15 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Clec4aQ9QZ15 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Clec4aQ9QZ15 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Clec4aQ9QZ15 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Clec4aQ9QZ15 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Clec4aQ9QZ15 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Clec4aQ9QZ15 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Clec4aQ9QZ15 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Clec4aQ9QZ15 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Clec4aQ9QZ15 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Clec4aQ9QZ15 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Clec4aQ9QZ15 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Clec4aQ9QZ15 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Clec4aQ9QZ15 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Clec4aQ9QZ15 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Clec4aQ9QZ15 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Clec4aQ9QZ15 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Clec4aQ9QZ15 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Clec4aQ9QZ15 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Clec4aQ9QZ15 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Clec4aQ9QZ15 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Clec4aQ9QZ15 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Clec4aQ9QZ15 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Clec4aQ9QZ15 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Clec4aQ9QZ15 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Clec4aQ9QZ15 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Clec4aQ9QZ15 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Clec4aQ9QZ15 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Clec4aQ9QZ15 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Clec4aQ9QZ15 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Clec4aQ9QZ15 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Clec4aQ9QZ15 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Clec4aQ9QZ15 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Clec4aQ9QZ15 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Clec4aQ9QZ15 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Clec4aQ9QZ15 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Clec4aQ9QZ15 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Clec4aQ9QZ15 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Clec4aQ9QZ15 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Clec4aQ9QZ15 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Clec4aQ9QZ15 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Clec4aQ9QZ15 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Clec4aQ9QZ15 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Clec4aQ9QZ15 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Clec4aQ9QZ15 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Clec4aQ9QZ15 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Clec4aQ9QZ15 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Clec4aQ9QZ15 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Clec4aQ9QZ15 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Clec4aQ9QZ15 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Clec4aQ9QZ15 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Clec4aQ9QZ15 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Clec4aQ9QZ15 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Clec4aQ9QZ15 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Clec4aQ9QZ15 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Clec4aQ9QZ15 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Clec4aQ9QZ15 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Clec4aQ9QZ15 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Clec4aQ9QZ15 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Clec4aQ9QZ15 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Clec4aQ9QZ15 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Clec4aQ9QZ15 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Clec4aQ9QZ15 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Clec4aQ9QZ15 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Clec4aQ9QZ15 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Clec4aQ9QZ15 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Clec4aQ9QZ15 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Clec4aQ9QZ15 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Clec4aQ9QZ15 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Clec4aQ9QZ15 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Clec4aQ9QZ15 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Clec4aQ9QZ15 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Clec4aQ9QZ15 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Clec4aQ9QZ15 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Clec4aQ9QZ15 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Clec4aQ9QZ15 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Clec4aQ9QZ15 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Clec4aQ9QZ15 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Clec4aQ9QZ15 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Clec4aQ9QZ15 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Clec4aQ9QZ15 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Clec4aQ9QZ15 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Clec4aQ9QZ15 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Clec4aQ9QZ15 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Clec4aQ9QZ15 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Clec4aQ9QZ15 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms