Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXW4

Fscn3, Fascin-3, mousemouse

Predictions only

Length 498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fscn3Q9QXW4 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fscn3Q9QXW4 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fscn3Q9QXW4 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fscn3Q9QXW4 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fscn3Q9QXW4 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fscn3Q9QXW4 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fscn3Q9QXW4 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fscn3Q9QXW4 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fscn3Q9QXW4 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fscn3Q9QXW4 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fscn3Q9QXW4 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fscn3Q9QXW4 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fscn3Q9QXW4 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Fscn3Q9QXW4 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Fscn3Q9QXW4 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Fscn3Q9QXW4 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Fscn3Q9QXW4 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fscn3Q9QXW4 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fscn3Q9QXW4 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fscn3Q9QXW4 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fscn3Q9QXW4 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fscn3Q9QXW4 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fscn3Q9QXW4 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fscn3Q9QXW4 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fscn3Q9QXW4 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fscn3Q9QXW4 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fscn3Q9QXW4 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fscn3Q9QXW4 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fscn3Q9QXW4 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fscn3Q9QXW4 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fscn3Q9QXW4 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fscn3Q9QXW4 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Fscn3Q9QXW4 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fscn3Q9QXW4 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fscn3Q9QXW4 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fscn3Q9QXW4 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fscn3Q9QXW4 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fscn3Q9QXW4 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fscn3Q9QXW4 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fscn3Q9QXW4 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Fscn3Q9QXW4 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fscn3Q9QXW4 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fscn3Q9QXW4 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fscn3Q9QXW4 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fscn3Q9QXW4 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fscn3Q9QXW4 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fscn3Q9QXW4 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fscn3Q9QXW4 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fscn3Q9QXW4 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fscn3Q9QXW4 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fscn3Q9QXW4 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fscn3Q9QXW4 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fscn3Q9QXW4 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fscn3Q9QXW4 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fscn3Q9QXW4 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fscn3Q9QXW4 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fscn3Q9QXW4 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fscn3Q9QXW4 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fscn3Q9QXW4 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fscn3Q9QXW4 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fscn3Q9QXW4 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Fscn3Q9QXW4 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Fscn3Q9QXW4 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Fscn3Q9QXW4 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fscn3Q9QXW4 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fscn3Q9QXW4 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fscn3Q9QXW4 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fscn3Q9QXW4 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Fscn3Q9QXW4 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fscn3Q9QXW4 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fscn3Q9QXW4 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Fscn3Q9QXW4 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Fscn3Q9QXW4 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fscn3Q9QXW4 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fscn3Q9QXW4 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Fscn3Q9QXW4 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fscn3Q9QXW4 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fscn3Q9QXW4 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fscn3Q9QXW4 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Fscn3Q9QXW4 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Fscn3Q9QXW4 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fscn3Q9QXW4 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fscn3Q9QXW4 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fscn3Q9QXW4 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Fscn3Q9QXW4 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Fscn3Q9QXW4 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Fscn3Q9QXW4 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Fscn3Q9QXW4 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fscn3Q9QXW4 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fscn3Q9QXW4 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fscn3Q9QXW4 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Fscn3Q9QXW4 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Fscn3Q9QXW4 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Fscn3Q9QXW4 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Fscn3Q9QXW4 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Fscn3Q9QXW4 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Fscn3Q9QXW4 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Fscn3Q9QXW4 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Fscn3Q9QXW4 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Fscn3Q9QXW4 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.6 ms