Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXE4

Trp53inp1, Tumor protein p53-inducible nuclear protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trp53inp1Q9QXE4 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Trp53inp1Q9QXE4 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Trp53inp1Q9QXE4 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Trp53inp1Q9QXE4 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Trp53inp1Q9QXE4 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Trp53inp1Q9QXE4 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Trp53inp1Q9QXE4 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Trp53inp1Q9QXE4 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Trp53inp1Q9QXE4 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Trp53inp1Q9QXE4 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Trp53inp1Q9QXE4 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Trp53inp1Q9QXE4 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Trp53inp1Q9QXE4 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Trp53inp1Q9QXE4 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Trp53inp1Q9QXE4 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Trp53inp1Q9QXE4 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Trp53inp1Q9QXE4 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Trp53inp1Q9QXE4 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Trp53inp1Q9QXE4 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Trp53inp1Q9QXE4 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Trp53inp1Q9QXE4 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Trp53inp1Q9QXE4 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Trp53inp1Q9QXE4 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Trp53inp1Q9QXE4 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Trp53inp1Q9QXE4 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Trp53inp1Q9QXE4 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Trp53inp1Q9QXE4 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Trp53inp1Q9QXE4 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Trp53inp1Q9QXE4 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Trp53inp1Q9QXE4 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Trp53inp1Q9QXE4 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Trp53inp1Q9QXE4 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Trp53inp1Q9QXE4 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Trp53inp1Q9QXE4 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Trp53inp1Q9QXE4 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Trp53inp1Q9QXE4 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Trp53inp1Q9QXE4 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Trp53inp1Q9QXE4 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Trp53inp1Q9QXE4 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Trp53inp1Q9QXE4 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Trp53inp1Q9QXE4 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Trp53inp1Q9QXE4 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Trp53inp1Q9QXE4 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Trp53inp1Q9QXE4 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Trp53inp1Q9QXE4 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Trp53inp1Q9QXE4 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Trp53inp1Q9QXE4 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Trp53inp1Q9QXE4 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Trp53inp1Q9QXE4 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Trp53inp1Q9QXE4 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Trp53inp1Q9QXE4 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Trp53inp1Q9QXE4 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Trp53inp1Q9QXE4 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Trp53inp1Q9QXE4 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Trp53inp1Q9QXE4 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Trp53inp1Q9QXE4 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Trp53inp1Q9QXE4 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Trp53inp1Q9QXE4 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Trp53inp1Q9QXE4 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Trp53inp1Q9QXE4 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Trp53inp1Q9QXE4 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Trp53inp1Q9QXE4 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Trp53inp1Q9QXE4 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Trp53inp1Q9QXE4 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Trp53inp1Q9QXE4 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Trp53inp1Q9QXE4 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Trp53inp1Q9QXE4 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Trp53inp1Q9QXE4 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Trp53inp1Q9QXE4 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Trp53inp1Q9QXE4 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Trp53inp1Q9QXE4 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Trp53inp1Q9QXE4 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Trp53inp1Q9QXE4 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Trp53inp1Q9QXE4 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Trp53inp1Q9QXE4 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Trp53inp1Q9QXE4 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Trp53inp1Q9QXE4 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Trp53inp1Q9QXE4 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Trp53inp1Q9QXE4 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Trp53inp1Q9QXE4 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Trp53inp1Q9QXE4 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Trp53inp1Q9QXE4 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Trp53inp1Q9QXE4 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Trp53inp1Q9QXE4 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Trp53inp1Q9QXE4 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Trp53inp1Q9QXE4 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Trp53inp1Q9QXE4 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Trp53inp1Q9QXE4 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Trp53inp1Q9QXE4 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Trp53inp1Q9QXE4 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Trp53inp1Q9QXE4 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Trp53inp1Q9QXE4 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Trp53inp1Q9QXE4 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Trp53inp1Q9QXE4 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Trp53inp1Q9QXE4 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Trp53inp1Q9QXE4 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Trp53inp1Q9QXE4 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Trp53inp1Q9QXE4 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Trp53inp1Q9QXE4 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Trp53inp1Q9QXE4 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms