Protein–RNA interactions for Protein: Q9QX15

Clca3a1, Calcium-activated chloride channel regulator 3A-1, mousemouse

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clca3a1Q9QX15 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Clca3a1Q9QX15 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Clca3a1Q9QX15 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Clca3a1Q9QX15 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Clca3a1Q9QX15 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Clca3a1Q9QX15 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Clca3a1Q9QX15 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Clca3a1Q9QX15 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Clca3a1Q9QX15 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Clca3a1Q9QX15 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Clca3a1Q9QX15 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Clca3a1Q9QX15 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Clca3a1Q9QX15 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Clca3a1Q9QX15 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Clca3a1Q9QX15 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Clca3a1Q9QX15 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Clca3a1Q9QX15 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Clca3a1Q9QX15 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Clca3a1Q9QX15 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Clca3a1Q9QX15 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Clca3a1Q9QX15 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Clca3a1Q9QX15 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Clca3a1Q9QX15 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Clca3a1Q9QX15 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Clca3a1Q9QX15 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Clca3a1Q9QX15 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Clca3a1Q9QX15 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Clca3a1Q9QX15 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Clca3a1Q9QX15 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Clca3a1Q9QX15 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Clca3a1Q9QX15 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Clca3a1Q9QX15 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Clca3a1Q9QX15 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Clca3a1Q9QX15 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Clca3a1Q9QX15 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Clca3a1Q9QX15 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Clca3a1Q9QX15 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Clca3a1Q9QX15 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Clca3a1Q9QX15 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Clca3a1Q9QX15 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Clca3a1Q9QX15 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Clca3a1Q9QX15 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Clca3a1Q9QX15 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Clca3a1Q9QX15 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Clca3a1Q9QX15 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Clca3a1Q9QX15 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Clca3a1Q9QX15 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Clca3a1Q9QX15 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Clca3a1Q9QX15 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Clca3a1Q9QX15 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Clca3a1Q9QX15 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Clca3a1Q9QX15 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Clca3a1Q9QX15 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Clca3a1Q9QX15 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Clca3a1Q9QX15 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Clca3a1Q9QX15 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Clca3a1Q9QX15 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Clca3a1Q9QX15 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Clca3a1Q9QX15 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Clca3a1Q9QX15 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Clca3a1Q9QX15 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Clca3a1Q9QX15 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Clca3a1Q9QX15 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Clca3a1Q9QX15 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Clca3a1Q9QX15 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Clca3a1Q9QX15 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Clca3a1Q9QX15 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Clca3a1Q9QX15 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Clca3a1Q9QX15 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Clca3a1Q9QX15 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Clca3a1Q9QX15 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Clca3a1Q9QX15 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Clca3a1Q9QX15 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Clca3a1Q9QX15 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Clca3a1Q9QX15 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Clca3a1Q9QX15 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Clca3a1Q9QX15 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Clca3a1Q9QX15 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Clca3a1Q9QX15 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Clca3a1Q9QX15 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Clca3a1Q9QX15 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Clca3a1Q9QX15 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Clca3a1Q9QX15 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Clca3a1Q9QX15 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Clca3a1Q9QX15 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Clca3a1Q9QX15 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Clca3a1Q9QX15 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Clca3a1Q9QX15 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Clca3a1Q9QX15 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Clca3a1Q9QX15 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Clca3a1Q9QX15 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Clca3a1Q9QX15 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Clca3a1Q9QX15 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Clca3a1Q9QX15 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Clca3a1Q9QX15 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Clca3a1Q9QX15 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Clca3a1Q9QX15 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Clca3a1Q9QX15 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Clca3a1Q9QX15 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Clca3a1Q9QX15 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.7 ms