Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUM9

Psma6, Proteasome subunit alpha type-6, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma6Q9QUM9 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Psma6Q9QUM9 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Psma6Q9QUM9 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Psma6Q9QUM9 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Psma6Q9QUM9 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Psma6Q9QUM9 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Psma6Q9QUM9 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Psma6Q9QUM9 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Psma6Q9QUM9 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Psma6Q9QUM9 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Psma6Q9QUM9 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Psma6Q9QUM9 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Psma6Q9QUM9 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Psma6Q9QUM9 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Psma6Q9QUM9 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Psma6Q9QUM9 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Psma6Q9QUM9 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Psma6Q9QUM9 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Psma6Q9QUM9 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Psma6Q9QUM9 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Psma6Q9QUM9 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Psma6Q9QUM9 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Psma6Q9QUM9 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Psma6Q9QUM9 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Psma6Q9QUM9 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Psma6Q9QUM9 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Psma6Q9QUM9 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Psma6Q9QUM9 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Psma6Q9QUM9 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Psma6Q9QUM9 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Psma6Q9QUM9 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Psma6Q9QUM9 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Psma6Q9QUM9 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Psma6Q9QUM9 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Psma6Q9QUM9 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Psma6Q9QUM9 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Psma6Q9QUM9 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Psma6Q9QUM9 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Psma6Q9QUM9 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Psma6Q9QUM9 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Psma6Q9QUM9 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Psma6Q9QUM9 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Psma6Q9QUM9 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Psma6Q9QUM9 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Psma6Q9QUM9 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Psma6Q9QUM9 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Psma6Q9QUM9 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Psma6Q9QUM9 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Psma6Q9QUM9 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Psma6Q9QUM9 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Psma6Q9QUM9 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Psma6Q9QUM9 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Psma6Q9QUM9 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Psma6Q9QUM9 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Psma6Q9QUM9 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Psma6Q9QUM9 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Psma6Q9QUM9 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Psma6Q9QUM9 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Psma6Q9QUM9 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Psma6Q9QUM9 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Psma6Q9QUM9 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Psma6Q9QUM9 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Psma6Q9QUM9 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Psma6Q9QUM9 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Psma6Q9QUM9 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Psma6Q9QUM9 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Psma6Q9QUM9 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Psma6Q9QUM9 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Psma6Q9QUM9 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Psma6Q9QUM9 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Psma6Q9QUM9 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Psma6Q9QUM9 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Psma6Q9QUM9 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Psma6Q9QUM9 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Psma6Q9QUM9 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Psma6Q9QUM9 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Psma6Q9QUM9 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Psma6Q9QUM9 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Psma6Q9QUM9 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Psma6Q9QUM9 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Psma6Q9QUM9 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Psma6Q9QUM9 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Psma6Q9QUM9 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Psma6Q9QUM9 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Psma6Q9QUM9 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Psma6Q9QUM9 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Psma6Q9QUM9 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Psma6Q9QUM9 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Psma6Q9QUM9 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Psma6Q9QUM9 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Psma6Q9QUM9 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Psma6Q9QUM9 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Psma6Q9QUM9 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Psma6Q9QUM9 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Psma6Q9QUM9 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Psma6Q9QUM9 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Psma6Q9QUM9 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Psma6Q9QUM9 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Psma6Q9QUM9 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Psma6Q9QUM9 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms