Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMH6

Txnrd1, Thioredoxin reductase 1, cytoplasmic, mousemouse

Predictions only

Length 613 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Txnrd1Q9JMH6 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
Txnrd1Q9JMH6 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
Txnrd1Q9JMH6 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
Txnrd1Q9JMH6 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.55■■■■□ 3.12
Txnrd1Q9JMH6 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
Txnrd1Q9JMH6 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
Txnrd1Q9JMH6 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC34.51■■■■□ 3.12
Txnrd1Q9JMH6 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
Txnrd1Q9JMH6 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
Txnrd1Q9JMH6 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC34.5■■■■□ 3.11
Txnrd1Q9JMH6 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
Txnrd1Q9JMH6 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
Txnrd1Q9JMH6 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
Txnrd1Q9JMH6 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
Txnrd1Q9JMH6 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.46■■■■□ 3.11
Txnrd1Q9JMH6 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
Txnrd1Q9JMH6 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.43■■■■□ 3.1
Txnrd1Q9JMH6 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
Txnrd1Q9JMH6 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
Txnrd1Q9JMH6 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Txnrd1Q9JMH6 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Txnrd1Q9JMH6 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Txnrd1Q9JMH6 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Txnrd1Q9JMH6 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Txnrd1Q9JMH6 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC34.34■■■■□ 3.09
Txnrd1Q9JMH6 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
Txnrd1Q9JMH6 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Txnrd1Q9JMH6 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
Txnrd1Q9JMH6 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
Txnrd1Q9JMH6 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.08
Txnrd1Q9JMH6 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC34.25■■■■□ 3.07
Txnrd1Q9JMH6 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Txnrd1Q9JMH6 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
Txnrd1Q9JMH6 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
Txnrd1Q9JMH6 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
Txnrd1Q9JMH6 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
Txnrd1Q9JMH6 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
Txnrd1Q9JMH6 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Txnrd1Q9JMH6 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
Txnrd1Q9JMH6 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC34.17■■■■□ 3.06
Txnrd1Q9JMH6 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
Txnrd1Q9JMH6 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC34.16■■■■□ 3.06
Txnrd1Q9JMH6 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC34.16■■■■□ 3.06
Txnrd1Q9JMH6 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Txnrd1Q9JMH6 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Txnrd1Q9JMH6 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Txnrd1Q9JMH6 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC34.14■■■■□ 3.06
Txnrd1Q9JMH6 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Txnrd1Q9JMH6 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.11■■■■□ 3.05
Txnrd1Q9JMH6 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Txnrd1Q9JMH6 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
Txnrd1Q9JMH6 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC34.08■■■■□ 3.05
Txnrd1Q9JMH6 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
Txnrd1Q9JMH6 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC34.05■■■■□ 3.04
Txnrd1Q9JMH6 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC34.05■■■■□ 3.04
Txnrd1Q9JMH6 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.04■■■■□ 3.04
Txnrd1Q9JMH6 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Txnrd1Q9JMH6 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Txnrd1Q9JMH6 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Txnrd1Q9JMH6 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Txnrd1Q9JMH6 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
Txnrd1Q9JMH6 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
Txnrd1Q9JMH6 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
Txnrd1Q9JMH6 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC33.97■■■■□ 3.03
Txnrd1Q9JMH6 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
Txnrd1Q9JMH6 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
Txnrd1Q9JMH6 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC33.95■■■■□ 3.03
Txnrd1Q9JMH6 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Txnrd1Q9JMH6 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Txnrd1Q9JMH6 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Txnrd1Q9JMH6 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Txnrd1Q9JMH6 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC33.91■■■■□ 3.02
Txnrd1Q9JMH6 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Txnrd1Q9JMH6 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Txnrd1Q9JMH6 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Txnrd1Q9JMH6 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Txnrd1Q9JMH6 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Txnrd1Q9JMH6 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
Txnrd1Q9JMH6 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Txnrd1Q9JMH6 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Txnrd1Q9JMH6 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
Txnrd1Q9JMH6 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Txnrd1Q9JMH6 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC33.82■■■■□ 3.01
Txnrd1Q9JMH6 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
Txnrd1Q9JMH6 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Txnrd1Q9JMH6 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
Txnrd1Q9JMH6 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC33.81■■■■□ 3
Txnrd1Q9JMH6 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
Txnrd1Q9JMH6 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC33.78■■■■□ 3
Txnrd1Q9JMH6 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
Txnrd1Q9JMH6 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Txnrd1Q9JMH6 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
Txnrd1Q9JMH6 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Txnrd1Q9JMH6 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Txnrd1Q9JMH6 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Txnrd1Q9JMH6 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Txnrd1Q9JMH6 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Txnrd1Q9JMH6 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Txnrd1Q9JMH6 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Txnrd1Q9JMH6 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.6 ms