Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMG7

Hdgfl3, Hepatoma-derived growth factor-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdgfl3Q9JMG7 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hdgfl3Q9JMG7 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hdgfl3Q9JMG7 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hdgfl3Q9JMG7 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hdgfl3Q9JMG7 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hdgfl3Q9JMG7 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hdgfl3Q9JMG7 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hdgfl3Q9JMG7 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hdgfl3Q9JMG7 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hdgfl3Q9JMG7 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Hdgfl3Q9JMG7 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Hdgfl3Q9JMG7 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Hdgfl3Q9JMG7 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hdgfl3Q9JMG7 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hdgfl3Q9JMG7 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hdgfl3Q9JMG7 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hdgfl3Q9JMG7 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hdgfl3Q9JMG7 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hdgfl3Q9JMG7 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hdgfl3Q9JMG7 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hdgfl3Q9JMG7 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hdgfl3Q9JMG7 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hdgfl3Q9JMG7 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hdgfl3Q9JMG7 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hdgfl3Q9JMG7 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hdgfl3Q9JMG7 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hdgfl3Q9JMG7 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hdgfl3Q9JMG7 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hdgfl3Q9JMG7 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hdgfl3Q9JMG7 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Hdgfl3Q9JMG7 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Hdgfl3Q9JMG7 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Hdgfl3Q9JMG7 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Hdgfl3Q9JMG7 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Hdgfl3Q9JMG7 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Hdgfl3Q9JMG7 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Hdgfl3Q9JMG7 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hdgfl3Q9JMG7 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hdgfl3Q9JMG7 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Hdgfl3Q9JMG7 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hdgfl3Q9JMG7 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Hdgfl3Q9JMG7 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Hdgfl3Q9JMG7 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hdgfl3Q9JMG7 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hdgfl3Q9JMG7 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hdgfl3Q9JMG7 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hdgfl3Q9JMG7 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hdgfl3Q9JMG7 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hdgfl3Q9JMG7 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hdgfl3Q9JMG7 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hdgfl3Q9JMG7 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hdgfl3Q9JMG7 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hdgfl3Q9JMG7 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hdgfl3Q9JMG7 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hdgfl3Q9JMG7 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hdgfl3Q9JMG7 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hdgfl3Q9JMG7 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hdgfl3Q9JMG7 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Hdgfl3Q9JMG7 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hdgfl3Q9JMG7 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hdgfl3Q9JMG7 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hdgfl3Q9JMG7 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hdgfl3Q9JMG7 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hdgfl3Q9JMG7 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hdgfl3Q9JMG7 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hdgfl3Q9JMG7 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hdgfl3Q9JMG7 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hdgfl3Q9JMG7 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hdgfl3Q9JMG7 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hdgfl3Q9JMG7 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Hdgfl3Q9JMG7 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Hdgfl3Q9JMG7 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hdgfl3Q9JMG7 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hdgfl3Q9JMG7 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hdgfl3Q9JMG7 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hdgfl3Q9JMG7 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Hdgfl3Q9JMG7 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hdgfl3Q9JMG7 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hdgfl3Q9JMG7 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hdgfl3Q9JMG7 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hdgfl3Q9JMG7 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hdgfl3Q9JMG7 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hdgfl3Q9JMG7 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hdgfl3Q9JMG7 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hdgfl3Q9JMG7 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Hdgfl3Q9JMG7 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hdgfl3Q9JMG7 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hdgfl3Q9JMG7 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hdgfl3Q9JMG7 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hdgfl3Q9JMG7 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Hdgfl3Q9JMG7 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Hdgfl3Q9JMG7 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Hdgfl3Q9JMG7 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Hdgfl3Q9JMG7 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Hdgfl3Q9JMG7 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Hdgfl3Q9JMG7 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Hdgfl3Q9JMG7 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Hdgfl3Q9JMG7 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Hdgfl3Q9JMG7 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Hdgfl3Q9JMG7 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.9 ms