Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLK4

Cabp2, Calcium-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cabp2Q9JLK4 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC33,47■■■□□ 2,95
Cabp2Q9JLK4 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,46■■■□□ 2,95
Cabp2Q9JLK4 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,46■■■□□ 2,95
Cabp2Q9JLK4 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC33,46■■■□□ 2,95
Cabp2Q9JLK4 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,46■■■□□ 2,95
Cabp2Q9JLK4 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC33,46■■■□□ 2,95
Cabp2Q9JLK4 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33,45■■■□□ 2,95
Cabp2Q9JLK4 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,44■■■□□ 2,94
Cabp2Q9JLK4 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33,42■■■□□ 2,94
Cabp2Q9JLK4 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC33,42■■■□□ 2,94
Cabp2Q9JLK4 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC33,41■■■□□ 2,94
Cabp2Q9JLK4 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC33,41■■■□□ 2,94
Cabp2Q9JLK4 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,41■■■□□ 2,94
Cabp2Q9JLK4 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33,39■■■□□ 2,94
Cabp2Q9JLK4 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33,39■■■□□ 2,93
Cabp2Q9JLK4 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC33,38■■■□□ 2,93
Cabp2Q9JLK4 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC33,38■■■□□ 2,93
Cabp2Q9JLK4 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC33,37■■■□□ 2,93
Cabp2Q9JLK4 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC33,37■■■□□ 2,93
Cabp2Q9JLK4 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33,36■■■□□ 2,93
Cabp2Q9JLK4 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33,35■■■□□ 2,93
Cabp2Q9JLK4 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,35■■■□□ 2,93
Cabp2Q9JLK4 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC33,33■■■□□ 2,93
Cabp2Q9JLK4 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,33■■■□□ 2,93
Cabp2Q9JLK4 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,32■■■□□ 2,92
Cabp2Q9JLK4 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,32■■■□□ 2,92
Cabp2Q9JLK4 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33,31■■■□□ 2,92
Cabp2Q9JLK4 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC33,31■■■□□ 2,92
Cabp2Q9JLK4 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC33,3■■■□□ 2,92
Cabp2Q9JLK4 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC33,3■■■□□ 2,92
Cabp2Q9JLK4 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC33,3■■■□□ 2,92
Cabp2Q9JLK4 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC33,28■■■□□ 2,92
Cabp2Q9JLK4 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC33,27■■■□□ 2,92
Cabp2Q9JLK4 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33,26■■■□□ 2,91
Cabp2Q9JLK4 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC33,26■■■□□ 2,91
Cabp2Q9JLK4 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC33,24■■■□□ 2,91
Cabp2Q9JLK4 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC33,23■■■□□ 2,91
Cabp2Q9JLK4 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC33,23■■■□□ 2,91
Cabp2Q9JLK4 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33,22■■■□□ 2,91
Cabp2Q9JLK4 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,21■■■□□ 2,91
Cabp2Q9JLK4 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC33,21■■■□□ 2,91
Cabp2Q9JLK4 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33,2■■■□□ 2,91
Cabp2Q9JLK4 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC33,17■■■□□ 2,9
Cabp2Q9JLK4 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,17■■■□□ 2,9
Cabp2Q9JLK4 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC33,16■■■□□ 2,9
Cabp2Q9JLK4 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33,15■■■□□ 2,9
Cabp2Q9JLK4 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,13■■■□□ 2,89
Cabp2Q9JLK4 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,13■■■□□ 2,89
Cabp2Q9JLK4 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC33,12■■■□□ 2,89
Cabp2Q9JLK4 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,12■■■□□ 2,89
Cabp2Q9JLK4 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,11■■■□□ 2,89
Cabp2Q9JLK4 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC33,1■■■□□ 2,89
Cabp2Q9JLK4 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC33,09■■■□□ 2,89
Cabp2Q9JLK4 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC33,09■■■□□ 2,89
Cabp2Q9JLK4 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33,09■■■□□ 2,89
Cabp2Q9JLK4 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,08■■■□□ 2,89
Cabp2Q9JLK4 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,08■■■□□ 2,89
Cabp2Q9JLK4 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33,07■■■□□ 2,88
Cabp2Q9JLK4 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,06■■■□□ 2,88
Cabp2Q9JLK4 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC33,05■■■□□ 2,88
Cabp2Q9JLK4 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33,04■■■□□ 2,88
Cabp2Q9JLK4 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33,04■■■□□ 2,88
Cabp2Q9JLK4 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC33,04■■■□□ 2,88
Cabp2Q9JLK4 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC33,02■■■□□ 2,88
Cabp2Q9JLK4 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,02■■■□□ 2,88
Cabp2Q9JLK4 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,01■■■□□ 2,88
Cabp2Q9JLK4 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2,87
Cabp2Q9JLK4 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2,87
Cabp2Q9JLK4 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32,99■■■□□ 2,87
Cabp2Q9JLK4 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC32,99■■■□□ 2,87
Cabp2Q9JLK4 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,98■■■□□ 2,87
Cabp2Q9JLK4 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32,97■■■□□ 2,87
Cabp2Q9JLK4 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC32,97■■■□□ 2,87
Cabp2Q9JLK4 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,97■■■□□ 2,87
Cabp2Q9JLK4 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC32,94■■■□□ 2,86
Cabp2Q9JLK4 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC32,93■■■□□ 2,86
Cabp2Q9JLK4 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC32,93■■■□□ 2,86
Cabp2Q9JLK4 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,92■■■□□ 2,86
Cabp2Q9JLK4 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32,92■■■□□ 2,86
Cabp2Q9JLK4 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,92■■■□□ 2,86
Cabp2Q9JLK4 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC32,9■■■□□ 2,86
Cabp2Q9JLK4 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,89■■■□□ 2,86
Cabp2Q9JLK4 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC32,89■■■□□ 2,86
Cabp2Q9JLK4 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32,88■■■□□ 2,85
Cabp2Q9JLK4 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC32,85■■■□□ 2,85
Cabp2Q9JLK4 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC32,85■■■□□ 2,85
Cabp2Q9JLK4 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC32,84■■■□□ 2,85
Cabp2Q9JLK4 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC32,83■■■□□ 2,85
Cabp2Q9JLK4 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC32,83■■■□□ 2,85
Cabp2Q9JLK4 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32,81■■■□□ 2,84
Cabp2Q9JLK4 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC32,81■■■□□ 2,84
Cabp2Q9JLK4 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC32,8■■■□□ 2,84
Cabp2Q9JLK4 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,79■■■□□ 2,84
Cabp2Q9JLK4 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32,78■■■□□ 2,84
Cabp2Q9JLK4 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC32,78■■■□□ 2,84
Cabp2Q9JLK4 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,77■■■□□ 2,84
Cabp2Q9JLK4 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,75■■■□□ 2,83
Cabp2Q9JLK4 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32,75■■■□□ 2,83
Cabp2Q9JLK4 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32,74■■■□□ 2,83
Cabp2Q9JLK4 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC32,73■■■□□ 2,83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12,5 ms