Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKE1

Trem3, TREM-3, mousemouse

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trem3Q9JKE1 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Trem3Q9JKE1 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Trem3Q9JKE1 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Trem3Q9JKE1 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Trem3Q9JKE1 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trem3Q9JKE1 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trem3Q9JKE1 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trem3Q9JKE1 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trem3Q9JKE1 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trem3Q9JKE1 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Trem3Q9JKE1 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trem3Q9JKE1 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trem3Q9JKE1 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trem3Q9JKE1 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trem3Q9JKE1 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trem3Q9JKE1 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trem3Q9JKE1 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Trem3Q9JKE1 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trem3Q9JKE1 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trem3Q9JKE1 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trem3Q9JKE1 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trem3Q9JKE1 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trem3Q9JKE1 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trem3Q9JKE1 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trem3Q9JKE1 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trem3Q9JKE1 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trem3Q9JKE1 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trem3Q9JKE1 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trem3Q9JKE1 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trem3Q9JKE1 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trem3Q9JKE1 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trem3Q9JKE1 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trem3Q9JKE1 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trem3Q9JKE1 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trem3Q9JKE1 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trem3Q9JKE1 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trem3Q9JKE1 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trem3Q9JKE1 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trem3Q9JKE1 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trem3Q9JKE1 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trem3Q9JKE1 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trem3Q9JKE1 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trem3Q9JKE1 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trem3Q9JKE1 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trem3Q9JKE1 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trem3Q9JKE1 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trem3Q9JKE1 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trem3Q9JKE1 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trem3Q9JKE1 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trem3Q9JKE1 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trem3Q9JKE1 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trem3Q9JKE1 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Trem3Q9JKE1 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trem3Q9JKE1 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trem3Q9JKE1 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trem3Q9JKE1 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trem3Q9JKE1 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trem3Q9JKE1 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trem3Q9JKE1 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trem3Q9JKE1 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trem3Q9JKE1 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trem3Q9JKE1 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Trem3Q9JKE1 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Trem3Q9JKE1 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trem3Q9JKE1 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trem3Q9JKE1 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trem3Q9JKE1 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trem3Q9JKE1 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trem3Q9JKE1 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Trem3Q9JKE1 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trem3Q9JKE1 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trem3Q9JKE1 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trem3Q9JKE1 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trem3Q9JKE1 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trem3Q9JKE1 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trem3Q9JKE1 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trem3Q9JKE1 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trem3Q9JKE1 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trem3Q9JKE1 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trem3Q9JKE1 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trem3Q9JKE1 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trem3Q9JKE1 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trem3Q9JKE1 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trem3Q9JKE1 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trem3Q9JKE1 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Trem3Q9JKE1 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trem3Q9JKE1 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trem3Q9JKE1 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trem3Q9JKE1 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trem3Q9JKE1 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Trem3Q9JKE1 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Trem3Q9JKE1 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Trem3Q9JKE1 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Trem3Q9JKE1 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Trem3Q9JKE1 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Trem3Q9JKE1 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Trem3Q9JKE1 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Trem3Q9JKE1 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Trem3Q9JKE1 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Trem3Q9JKE1 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.1 ms