Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJN0

Polh, DNA polymerase eta, mousemouse

Predictions only

Length 694 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolhQ9JJN0 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PolhQ9JJN0 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PolhQ9JJN0 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PolhQ9JJN0 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PolhQ9JJN0 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PolhQ9JJN0 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PolhQ9JJN0 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PolhQ9JJN0 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PolhQ9JJN0 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PolhQ9JJN0 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PolhQ9JJN0 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PolhQ9JJN0 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PolhQ9JJN0 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PolhQ9JJN0 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PolhQ9JJN0 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PolhQ9JJN0 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PolhQ9JJN0 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PolhQ9JJN0 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PolhQ9JJN0 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PolhQ9JJN0 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PolhQ9JJN0 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PolhQ9JJN0 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PolhQ9JJN0 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PolhQ9JJN0 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PolhQ9JJN0 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PolhQ9JJN0 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PolhQ9JJN0 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PolhQ9JJN0 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PolhQ9JJN0 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PolhQ9JJN0 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PolhQ9JJN0 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PolhQ9JJN0 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PolhQ9JJN0 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PolhQ9JJN0 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
PolhQ9JJN0 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PolhQ9JJN0 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
PolhQ9JJN0 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PolhQ9JJN0 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PolhQ9JJN0 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PolhQ9JJN0 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PolhQ9JJN0 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PolhQ9JJN0 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PolhQ9JJN0 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PolhQ9JJN0 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PolhQ9JJN0 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PolhQ9JJN0 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PolhQ9JJN0 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PolhQ9JJN0 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PolhQ9JJN0 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PolhQ9JJN0 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PolhQ9JJN0 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PolhQ9JJN0 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PolhQ9JJN0 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
PolhQ9JJN0 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PolhQ9JJN0 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PolhQ9JJN0 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PolhQ9JJN0 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PolhQ9JJN0 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PolhQ9JJN0 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PolhQ9JJN0 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PolhQ9JJN0 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PolhQ9JJN0 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PolhQ9JJN0 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
PolhQ9JJN0 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PolhQ9JJN0 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PolhQ9JJN0 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PolhQ9JJN0 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PolhQ9JJN0 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PolhQ9JJN0 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PolhQ9JJN0 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PolhQ9JJN0 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
PolhQ9JJN0 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
PolhQ9JJN0 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
PolhQ9JJN0 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PolhQ9JJN0 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PolhQ9JJN0 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
PolhQ9JJN0 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PolhQ9JJN0 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PolhQ9JJN0 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PolhQ9JJN0 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PolhQ9JJN0 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PolhQ9JJN0 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
PolhQ9JJN0 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PolhQ9JJN0 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PolhQ9JJN0 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PolhQ9JJN0 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PolhQ9JJN0 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PolhQ9JJN0 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PolhQ9JJN0 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PolhQ9JJN0 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PolhQ9JJN0 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PolhQ9JJN0 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PolhQ9JJN0 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PolhQ9JJN0 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PolhQ9JJN0 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PolhQ9JJN0 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PolhQ9JJN0 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PolhQ9JJN0 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PolhQ9JJN0 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PolhQ9JJN0 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms