Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJ59

Abcb9, ATP-binding cassette sub-family B member 9, mousemouse

Predictions only

Length 762 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcb9Q9JJ59 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Abcb9Q9JJ59 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Abcb9Q9JJ59 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Abcb9Q9JJ59 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Abcb9Q9JJ59 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Abcb9Q9JJ59 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Abcb9Q9JJ59 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Abcb9Q9JJ59 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Abcb9Q9JJ59 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Abcb9Q9JJ59 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Abcb9Q9JJ59 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Abcb9Q9JJ59 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Abcb9Q9JJ59 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Abcb9Q9JJ59 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Abcb9Q9JJ59 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Abcb9Q9JJ59 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Abcb9Q9JJ59 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Abcb9Q9JJ59 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Abcb9Q9JJ59 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Abcb9Q9JJ59 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Abcb9Q9JJ59 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Abcb9Q9JJ59 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Abcb9Q9JJ59 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Abcb9Q9JJ59 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Abcb9Q9JJ59 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Abcb9Q9JJ59 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Abcb9Q9JJ59 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Abcb9Q9JJ59 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Abcb9Q9JJ59 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Abcb9Q9JJ59 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Abcb9Q9JJ59 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Abcb9Q9JJ59 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Abcb9Q9JJ59 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Abcb9Q9JJ59 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Abcb9Q9JJ59 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Abcb9Q9JJ59 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Abcb9Q9JJ59 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Abcb9Q9JJ59 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Abcb9Q9JJ59 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Abcb9Q9JJ59 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Abcb9Q9JJ59 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Abcb9Q9JJ59 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Abcb9Q9JJ59 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Abcb9Q9JJ59 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Abcb9Q9JJ59 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Abcb9Q9JJ59 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Abcb9Q9JJ59 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Abcb9Q9JJ59 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Abcb9Q9JJ59 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Abcb9Q9JJ59 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Abcb9Q9JJ59 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Abcb9Q9JJ59 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Abcb9Q9JJ59 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Abcb9Q9JJ59 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Abcb9Q9JJ59 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Abcb9Q9JJ59 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Abcb9Q9JJ59 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Abcb9Q9JJ59 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Abcb9Q9JJ59 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Abcb9Q9JJ59 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Abcb9Q9JJ59 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Abcb9Q9JJ59 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Abcb9Q9JJ59 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Abcb9Q9JJ59 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Abcb9Q9JJ59 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Abcb9Q9JJ59 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Abcb9Q9JJ59 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Abcb9Q9JJ59 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Abcb9Q9JJ59 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Abcb9Q9JJ59 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Abcb9Q9JJ59 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Abcb9Q9JJ59 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Abcb9Q9JJ59 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Abcb9Q9JJ59 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Abcb9Q9JJ59 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Abcb9Q9JJ59 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Abcb9Q9JJ59 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Abcb9Q9JJ59 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Abcb9Q9JJ59 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Abcb9Q9JJ59 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Abcb9Q9JJ59 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Abcb9Q9JJ59 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Abcb9Q9JJ59 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Abcb9Q9JJ59 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Abcb9Q9JJ59 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Abcb9Q9JJ59 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Abcb9Q9JJ59 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Abcb9Q9JJ59 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Abcb9Q9JJ59 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Abcb9Q9JJ59 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Abcb9Q9JJ59 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Abcb9Q9JJ59 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Abcb9Q9JJ59 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Abcb9Q9JJ59 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Abcb9Q9JJ59 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Abcb9Q9JJ59 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Abcb9Q9JJ59 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Abcb9Q9JJ59 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Abcb9Q9JJ59 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Abcb9Q9JJ59 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms