Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJ57

Kcnip1, Kv channel-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnip1Q9JJ57 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Kcnip1Q9JJ57 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Kcnip1Q9JJ57 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Kcnip1Q9JJ57 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Kcnip1Q9JJ57 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Kcnip1Q9JJ57 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Kcnip1Q9JJ57 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Kcnip1Q9JJ57 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Kcnip1Q9JJ57 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Kcnip1Q9JJ57 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Kcnip1Q9JJ57 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
Kcnip1Q9JJ57 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Kcnip1Q9JJ57 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Kcnip1Q9JJ57 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Kcnip1Q9JJ57 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Kcnip1Q9JJ57 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Kcnip1Q9JJ57 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Kcnip1Q9JJ57 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Kcnip1Q9JJ57 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Kcnip1Q9JJ57 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Kcnip1Q9JJ57 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Kcnip1Q9JJ57 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Kcnip1Q9JJ57 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Kcnip1Q9JJ57 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Kcnip1Q9JJ57 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Kcnip1Q9JJ57 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Kcnip1Q9JJ57 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Kcnip1Q9JJ57 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Kcnip1Q9JJ57 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Kcnip1Q9JJ57 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Kcnip1Q9JJ57 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Kcnip1Q9JJ57 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Kcnip1Q9JJ57 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Kcnip1Q9JJ57 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Kcnip1Q9JJ57 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Kcnip1Q9JJ57 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Kcnip1Q9JJ57 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Kcnip1Q9JJ57 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Kcnip1Q9JJ57 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Kcnip1Q9JJ57 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Kcnip1Q9JJ57 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Kcnip1Q9JJ57 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Kcnip1Q9JJ57 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Kcnip1Q9JJ57 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Kcnip1Q9JJ57 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Kcnip1Q9JJ57 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Kcnip1Q9JJ57 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Kcnip1Q9JJ57 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Kcnip1Q9JJ57 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Kcnip1Q9JJ57 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Kcnip1Q9JJ57 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Kcnip1Q9JJ57 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Kcnip1Q9JJ57 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Kcnip1Q9JJ57 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Kcnip1Q9JJ57 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
Kcnip1Q9JJ57 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Kcnip1Q9JJ57 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Kcnip1Q9JJ57 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Kcnip1Q9JJ57 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Kcnip1Q9JJ57 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Kcnip1Q9JJ57 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Kcnip1Q9JJ57 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Kcnip1Q9JJ57 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Kcnip1Q9JJ57 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Kcnip1Q9JJ57 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Kcnip1Q9JJ57 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Kcnip1Q9JJ57 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Kcnip1Q9JJ57 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Kcnip1Q9JJ57 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Kcnip1Q9JJ57 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Kcnip1Q9JJ57 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Kcnip1Q9JJ57 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Kcnip1Q9JJ57 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Kcnip1Q9JJ57 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Kcnip1Q9JJ57 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Kcnip1Q9JJ57 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Kcnip1Q9JJ57 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Kcnip1Q9JJ57 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Kcnip1Q9JJ57 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Kcnip1Q9JJ57 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Kcnip1Q9JJ57 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Kcnip1Q9JJ57 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Kcnip1Q9JJ57 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Kcnip1Q9JJ57 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Kcnip1Q9JJ57 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Kcnip1Q9JJ57 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Kcnip1Q9JJ57 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Kcnip1Q9JJ57 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Kcnip1Q9JJ57 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Kcnip1Q9JJ57 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Kcnip1Q9JJ57 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Kcnip1Q9JJ57 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Kcnip1Q9JJ57 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Kcnip1Q9JJ57 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Kcnip1Q9JJ57 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Kcnip1Q9JJ57 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Kcnip1Q9JJ57 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Kcnip1Q9JJ57 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Kcnip1Q9JJ57 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Kcnip1Q9JJ57 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms