Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI57

Gtf2ird1, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2ird1Q9JI57 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Gtf2ird1Q9JI57 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Gtf2ird1Q9JI57 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Gtf2ird1Q9JI57 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Gtf2ird1Q9JI57 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Gtf2ird1Q9JI57 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Gtf2ird1Q9JI57 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Gtf2ird1Q9JI57 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Gtf2ird1Q9JI57 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Gtf2ird1Q9JI57 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Gtf2ird1Q9JI57 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Gtf2ird1Q9JI57 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Gtf2ird1Q9JI57 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Gtf2ird1Q9JI57 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Gtf2ird1Q9JI57 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Gtf2ird1Q9JI57 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Gtf2ird1Q9JI57 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Gtf2ird1Q9JI57 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Gtf2ird1Q9JI57 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Gtf2ird1Q9JI57 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Gtf2ird1Q9JI57 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Gtf2ird1Q9JI57 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Gtf2ird1Q9JI57 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Gtf2ird1Q9JI57 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Gtf2ird1Q9JI57 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Gtf2ird1Q9JI57 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Gtf2ird1Q9JI57 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Gtf2ird1Q9JI57 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Gtf2ird1Q9JI57 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Gtf2ird1Q9JI57 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Gtf2ird1Q9JI57 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Gtf2ird1Q9JI57 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Gtf2ird1Q9JI57 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Gtf2ird1Q9JI57 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Gtf2ird1Q9JI57 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Gtf2ird1Q9JI57 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Gtf2ird1Q9JI57 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Gtf2ird1Q9JI57 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Gtf2ird1Q9JI57 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Gtf2ird1Q9JI57 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Gtf2ird1Q9JI57 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Gtf2ird1Q9JI57 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Gtf2ird1Q9JI57 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Gtf2ird1Q9JI57 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Gtf2ird1Q9JI57 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Gtf2ird1Q9JI57 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Gtf2ird1Q9JI57 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Gtf2ird1Q9JI57 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Gtf2ird1Q9JI57 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Gtf2ird1Q9JI57 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
Gtf2ird1Q9JI57 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Gtf2ird1Q9JI57 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Gtf2ird1Q9JI57 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Gtf2ird1Q9JI57 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Gtf2ird1Q9JI57 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
Gtf2ird1Q9JI57 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Gtf2ird1Q9JI57 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Gtf2ird1Q9JI57 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Gtf2ird1Q9JI57 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Gtf2ird1Q9JI57 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Gtf2ird1Q9JI57 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Gtf2ird1Q9JI57 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Gtf2ird1Q9JI57 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Gtf2ird1Q9JI57 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Gtf2ird1Q9JI57 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Gtf2ird1Q9JI57 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Gtf2ird1Q9JI57 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Gtf2ird1Q9JI57 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Gtf2ird1Q9JI57 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Gtf2ird1Q9JI57 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Gtf2ird1Q9JI57 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Gtf2ird1Q9JI57 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Gtf2ird1Q9JI57 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Gtf2ird1Q9JI57 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Gtf2ird1Q9JI57 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Gtf2ird1Q9JI57 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Gtf2ird1Q9JI57 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Gtf2ird1Q9JI57 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Gtf2ird1Q9JI57 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Gtf2ird1Q9JI57 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Gtf2ird1Q9JI57 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Gtf2ird1Q9JI57 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Gtf2ird1Q9JI57 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Gtf2ird1Q9JI57 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Gtf2ird1Q9JI57 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Gtf2ird1Q9JI57 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Gtf2ird1Q9JI57 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Gtf2ird1Q9JI57 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Gtf2ird1Q9JI57 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Gtf2ird1Q9JI57 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Gtf2ird1Q9JI57 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Gtf2ird1Q9JI57 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Gtf2ird1Q9JI57 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Gtf2ird1Q9JI57 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Gtf2ird1Q9JI57 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Gtf2ird1Q9JI57 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Gtf2ird1Q9JI57 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Gtf2ird1Q9JI57 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Gtf2ird1Q9JI57 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Gtf2ird1Q9JI57 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms