Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHS9

Cwc15, Spliceosome-associated protein CWC15 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cwc15Q9JHS9 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Cwc15Q9JHS9 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Cwc15Q9JHS9 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Cwc15Q9JHS9 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Cwc15Q9JHS9 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Cwc15Q9JHS9 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Cwc15Q9JHS9 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Cwc15Q9JHS9 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Cwc15Q9JHS9 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Cwc15Q9JHS9 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Cwc15Q9JHS9 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Cwc15Q9JHS9 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Cwc15Q9JHS9 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Cwc15Q9JHS9 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Cwc15Q9JHS9 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Cwc15Q9JHS9 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Cwc15Q9JHS9 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Cwc15Q9JHS9 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Cwc15Q9JHS9 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Cwc15Q9JHS9 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Cwc15Q9JHS9 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Cwc15Q9JHS9 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Cwc15Q9JHS9 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cwc15Q9JHS9 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cwc15Q9JHS9 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Cwc15Q9JHS9 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Cwc15Q9JHS9 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Cwc15Q9JHS9 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Cwc15Q9JHS9 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Cwc15Q9JHS9 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Cwc15Q9JHS9 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Cwc15Q9JHS9 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Cwc15Q9JHS9 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Cwc15Q9JHS9 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Cwc15Q9JHS9 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Cwc15Q9JHS9 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Cwc15Q9JHS9 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Cwc15Q9JHS9 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Cwc15Q9JHS9 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Cwc15Q9JHS9 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Cwc15Q9JHS9 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Cwc15Q9JHS9 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Cwc15Q9JHS9 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Cwc15Q9JHS9 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Cwc15Q9JHS9 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Cwc15Q9JHS9 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Cwc15Q9JHS9 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Cwc15Q9JHS9 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Cwc15Q9JHS9 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Cwc15Q9JHS9 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Cwc15Q9JHS9 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Cwc15Q9JHS9 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Cwc15Q9JHS9 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Cwc15Q9JHS9 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Cwc15Q9JHS9 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Cwc15Q9JHS9 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Cwc15Q9JHS9 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Cwc15Q9JHS9 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Cwc15Q9JHS9 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Cwc15Q9JHS9 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Cwc15Q9JHS9 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Cwc15Q9JHS9 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Cwc15Q9JHS9 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Cwc15Q9JHS9 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Cwc15Q9JHS9 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Cwc15Q9JHS9 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Cwc15Q9JHS9 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Cwc15Q9JHS9 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Cwc15Q9JHS9 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Cwc15Q9JHS9 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Cwc15Q9JHS9 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Cwc15Q9JHS9 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Cwc15Q9JHS9 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Cwc15Q9JHS9 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Cwc15Q9JHS9 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Cwc15Q9JHS9 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Cwc15Q9JHS9 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Cwc15Q9JHS9 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Cwc15Q9JHS9 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Cwc15Q9JHS9 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Cwc15Q9JHS9 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Cwc15Q9JHS9 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Cwc15Q9JHS9 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Cwc15Q9JHS9 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Cwc15Q9JHS9 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Cwc15Q9JHS9 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Cwc15Q9JHS9 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Cwc15Q9JHS9 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Cwc15Q9JHS9 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Cwc15Q9JHS9 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Cwc15Q9JHS9 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Cwc15Q9JHS9 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Cwc15Q9JHS9 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Cwc15Q9JHS9 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Cwc15Q9JHS9 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Cwc15Q9JHS9 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Cwc15Q9JHS9 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Cwc15Q9JHS9 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Cwc15Q9JHS9 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Cwc15Q9JHS9 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms