Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHI9

Slc40a1, Solute carrier family 40 member 1, mousemouse

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc40a1Q9JHI9 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Slc40a1Q9JHI9 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Slc40a1Q9JHI9 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Slc40a1Q9JHI9 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Slc40a1Q9JHI9 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Slc40a1Q9JHI9 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Slc40a1Q9JHI9 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Slc40a1Q9JHI9 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Slc40a1Q9JHI9 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Slc40a1Q9JHI9 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Slc40a1Q9JHI9 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Slc40a1Q9JHI9 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Slc40a1Q9JHI9 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Slc40a1Q9JHI9 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Slc40a1Q9JHI9 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Slc40a1Q9JHI9 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Slc40a1Q9JHI9 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Slc40a1Q9JHI9 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Slc40a1Q9JHI9 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Slc40a1Q9JHI9 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Slc40a1Q9JHI9 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Slc40a1Q9JHI9 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Slc40a1Q9JHI9 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Slc40a1Q9JHI9 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Slc40a1Q9JHI9 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Slc40a1Q9JHI9 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Slc40a1Q9JHI9 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Slc40a1Q9JHI9 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Slc40a1Q9JHI9 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Slc40a1Q9JHI9 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Slc40a1Q9JHI9 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Slc40a1Q9JHI9 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Slc40a1Q9JHI9 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Slc40a1Q9JHI9 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Slc40a1Q9JHI9 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Slc40a1Q9JHI9 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Slc40a1Q9JHI9 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Slc40a1Q9JHI9 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Slc40a1Q9JHI9 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Slc40a1Q9JHI9 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Slc40a1Q9JHI9 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Slc40a1Q9JHI9 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Slc40a1Q9JHI9 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Slc40a1Q9JHI9 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Slc40a1Q9JHI9 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Slc40a1Q9JHI9 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Slc40a1Q9JHI9 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Slc40a1Q9JHI9 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Slc40a1Q9JHI9 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Slc40a1Q9JHI9 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Slc40a1Q9JHI9 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Slc40a1Q9JHI9 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Slc40a1Q9JHI9 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Slc40a1Q9JHI9 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Slc40a1Q9JHI9 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Slc40a1Q9JHI9 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Slc40a1Q9JHI9 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Slc40a1Q9JHI9 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Slc40a1Q9JHI9 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Slc40a1Q9JHI9 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Slc40a1Q9JHI9 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Slc40a1Q9JHI9 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Slc40a1Q9JHI9 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Slc40a1Q9JHI9 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Slc40a1Q9JHI9 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Slc40a1Q9JHI9 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Slc40a1Q9JHI9 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Slc40a1Q9JHI9 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Slc40a1Q9JHI9 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Slc40a1Q9JHI9 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Slc40a1Q9JHI9 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Slc40a1Q9JHI9 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Slc40a1Q9JHI9 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Slc40a1Q9JHI9 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Slc40a1Q9JHI9 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Slc40a1Q9JHI9 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Slc40a1Q9JHI9 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Slc40a1Q9JHI9 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Slc40a1Q9JHI9 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Slc40a1Q9JHI9 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Slc40a1Q9JHI9 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Slc40a1Q9JHI9 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Slc40a1Q9JHI9 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Slc40a1Q9JHI9 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Slc40a1Q9JHI9 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Slc40a1Q9JHI9 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Slc40a1Q9JHI9 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Slc40a1Q9JHI9 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Slc40a1Q9JHI9 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Slc40a1Q9JHI9 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Slc40a1Q9JHI9 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Slc40a1Q9JHI9 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Slc40a1Q9JHI9 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Slc40a1Q9JHI9 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Slc40a1Q9JHI9 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Slc40a1Q9JHI9 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Slc40a1Q9JHI9 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Slc40a1Q9JHI9 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Slc40a1Q9JHI9 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Slc40a1Q9JHI9 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.2 ms