Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES81

Popdc3, Popeye domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Popdc3Q9ES81 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Popdc3Q9ES81 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Popdc3Q9ES81 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Popdc3Q9ES81 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Popdc3Q9ES81 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Popdc3Q9ES81 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Popdc3Q9ES81 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Popdc3Q9ES81 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Popdc3Q9ES81 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Popdc3Q9ES81 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Popdc3Q9ES81 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Popdc3Q9ES81 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Popdc3Q9ES81 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Popdc3Q9ES81 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Popdc3Q9ES81 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Popdc3Q9ES81 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Popdc3Q9ES81 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Popdc3Q9ES81 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Popdc3Q9ES81 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Popdc3Q9ES81 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Popdc3Q9ES81 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Popdc3Q9ES81 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Popdc3Q9ES81 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Popdc3Q9ES81 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Popdc3Q9ES81 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Popdc3Q9ES81 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Popdc3Q9ES81 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Popdc3Q9ES81 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Popdc3Q9ES81 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Popdc3Q9ES81 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Popdc3Q9ES81 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Popdc3Q9ES81 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Popdc3Q9ES81 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Popdc3Q9ES81 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Popdc3Q9ES81 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Popdc3Q9ES81 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Popdc3Q9ES81 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Popdc3Q9ES81 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Popdc3Q9ES81 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Popdc3Q9ES81 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Popdc3Q9ES81 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Popdc3Q9ES81 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Popdc3Q9ES81 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Popdc3Q9ES81 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Popdc3Q9ES81 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Popdc3Q9ES81 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Popdc3Q9ES81 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Popdc3Q9ES81 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Popdc3Q9ES81 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Popdc3Q9ES81 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Popdc3Q9ES81 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Popdc3Q9ES81 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Popdc3Q9ES81 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Popdc3Q9ES81 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Popdc3Q9ES81 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Popdc3Q9ES81 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Popdc3Q9ES81 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Popdc3Q9ES81 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Popdc3Q9ES81 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Popdc3Q9ES81 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Popdc3Q9ES81 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Popdc3Q9ES81 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Popdc3Q9ES81 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Popdc3Q9ES81 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Popdc3Q9ES81 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Popdc3Q9ES81 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Popdc3Q9ES81 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Popdc3Q9ES81 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Popdc3Q9ES81 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Popdc3Q9ES81 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Popdc3Q9ES81 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Popdc3Q9ES81 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Popdc3Q9ES81 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Popdc3Q9ES81 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Popdc3Q9ES81 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Popdc3Q9ES81 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Popdc3Q9ES81 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Popdc3Q9ES81 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Popdc3Q9ES81 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Popdc3Q9ES81 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Popdc3Q9ES81 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Popdc3Q9ES81 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Popdc3Q9ES81 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Popdc3Q9ES81 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Popdc3Q9ES81 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Popdc3Q9ES81 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Popdc3Q9ES81 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Popdc3Q9ES81 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Popdc3Q9ES81 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Popdc3Q9ES81 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Popdc3Q9ES81 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Popdc3Q9ES81 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Popdc3Q9ES81 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Popdc3Q9ES81 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Popdc3Q9ES81 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Popdc3Q9ES81 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Popdc3Q9ES81 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Popdc3Q9ES81 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Popdc3Q9ES81 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Popdc3Q9ES81 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms