Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES81

Popdc3, Popeye domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Popdc3Q9ES81 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Popdc3Q9ES81 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Popdc3Q9ES81 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Popdc3Q9ES81 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Popdc3Q9ES81 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Popdc3Q9ES81 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Popdc3Q9ES81 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Popdc3Q9ES81 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Popdc3Q9ES81 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Popdc3Q9ES81 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Popdc3Q9ES81 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Popdc3Q9ES81 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Popdc3Q9ES81 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Popdc3Q9ES81 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Popdc3Q9ES81 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Popdc3Q9ES81 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Popdc3Q9ES81 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Popdc3Q9ES81 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Popdc3Q9ES81 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Popdc3Q9ES81 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Popdc3Q9ES81 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Popdc3Q9ES81 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Popdc3Q9ES81 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Popdc3Q9ES81 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Popdc3Q9ES81 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Popdc3Q9ES81 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Popdc3Q9ES81 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Popdc3Q9ES81 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Popdc3Q9ES81 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Popdc3Q9ES81 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Popdc3Q9ES81 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Popdc3Q9ES81 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Popdc3Q9ES81 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Popdc3Q9ES81 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Popdc3Q9ES81 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Popdc3Q9ES81 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Popdc3Q9ES81 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Popdc3Q9ES81 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Popdc3Q9ES81 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Popdc3Q9ES81 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Popdc3Q9ES81 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Popdc3Q9ES81 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Popdc3Q9ES81 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Popdc3Q9ES81 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Popdc3Q9ES81 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Popdc3Q9ES81 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Popdc3Q9ES81 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Popdc3Q9ES81 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Popdc3Q9ES81 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Popdc3Q9ES81 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Popdc3Q9ES81 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Popdc3Q9ES81 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Popdc3Q9ES81 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Popdc3Q9ES81 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Popdc3Q9ES81 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Popdc3Q9ES81 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Popdc3Q9ES81 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Popdc3Q9ES81 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Popdc3Q9ES81 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Popdc3Q9ES81 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Popdc3Q9ES81 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Popdc3Q9ES81 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Popdc3Q9ES81 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Popdc3Q9ES81 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Popdc3Q9ES81 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Popdc3Q9ES81 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Popdc3Q9ES81 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Popdc3Q9ES81 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Popdc3Q9ES81 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Popdc3Q9ES81 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Popdc3Q9ES81 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Popdc3Q9ES81 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Popdc3Q9ES81 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Popdc3Q9ES81 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Popdc3Q9ES81 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Popdc3Q9ES81 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Popdc3Q9ES81 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Popdc3Q9ES81 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Popdc3Q9ES81 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Popdc3Q9ES81 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Popdc3Q9ES81 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Popdc3Q9ES81 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Popdc3Q9ES81 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Popdc3Q9ES81 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Popdc3Q9ES81 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Popdc3Q9ES81 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Popdc3Q9ES81 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Popdc3Q9ES81 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Popdc3Q9ES81 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Popdc3Q9ES81 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Popdc3Q9ES81 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Popdc3Q9ES81 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Popdc3Q9ES81 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Popdc3Q9ES81 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Popdc3Q9ES81 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Popdc3Q9ES81 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Popdc3Q9ES81 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Popdc3Q9ES81 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Popdc3Q9ES81 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Popdc3Q9ES81 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.6 ms