Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERR7

Selenof, Selenoprotein F, mousemouse

Predictions only

Length 162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SelenofQ9ERR7 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SelenofQ9ERR7 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SelenofQ9ERR7 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SelenofQ9ERR7 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SelenofQ9ERR7 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SelenofQ9ERR7 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SelenofQ9ERR7 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SelenofQ9ERR7 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SelenofQ9ERR7 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SelenofQ9ERR7 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SelenofQ9ERR7 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SelenofQ9ERR7 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SelenofQ9ERR7 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SelenofQ9ERR7 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SelenofQ9ERR7 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
SelenofQ9ERR7 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SelenofQ9ERR7 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SelenofQ9ERR7 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SelenofQ9ERR7 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SelenofQ9ERR7 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SelenofQ9ERR7 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SelenofQ9ERR7 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SelenofQ9ERR7 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SelenofQ9ERR7 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SelenofQ9ERR7 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SelenofQ9ERR7 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SelenofQ9ERR7 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SelenofQ9ERR7 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SelenofQ9ERR7 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SelenofQ9ERR7 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SelenofQ9ERR7 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SelenofQ9ERR7 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SelenofQ9ERR7 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SelenofQ9ERR7 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SelenofQ9ERR7 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SelenofQ9ERR7 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SelenofQ9ERR7 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SelenofQ9ERR7 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SelenofQ9ERR7 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SelenofQ9ERR7 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SelenofQ9ERR7 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SelenofQ9ERR7 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SelenofQ9ERR7 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SelenofQ9ERR7 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SelenofQ9ERR7 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
SelenofQ9ERR7 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SelenofQ9ERR7 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SelenofQ9ERR7 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SelenofQ9ERR7 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SelenofQ9ERR7 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SelenofQ9ERR7 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SelenofQ9ERR7 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SelenofQ9ERR7 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SelenofQ9ERR7 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SelenofQ9ERR7 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SelenofQ9ERR7 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SelenofQ9ERR7 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SelenofQ9ERR7 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SelenofQ9ERR7 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SelenofQ9ERR7 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SelenofQ9ERR7 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SelenofQ9ERR7 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SelenofQ9ERR7 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SelenofQ9ERR7 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SelenofQ9ERR7 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
SelenofQ9ERR7 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SelenofQ9ERR7 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SelenofQ9ERR7 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SelenofQ9ERR7 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SelenofQ9ERR7 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
SelenofQ9ERR7 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SelenofQ9ERR7 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SelenofQ9ERR7 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SelenofQ9ERR7 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SelenofQ9ERR7 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SelenofQ9ERR7 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SelenofQ9ERR7 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SelenofQ9ERR7 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SelenofQ9ERR7 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SelenofQ9ERR7 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SelenofQ9ERR7 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SelenofQ9ERR7 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SelenofQ9ERR7 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SelenofQ9ERR7 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SelenofQ9ERR7 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SelenofQ9ERR7 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SelenofQ9ERR7 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SelenofQ9ERR7 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SelenofQ9ERR7 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SelenofQ9ERR7 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SelenofQ9ERR7 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SelenofQ9ERR7 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SelenofQ9ERR7 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SelenofQ9ERR7 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SelenofQ9ERR7 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SelenofQ9ERR7 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SelenofQ9ERR7 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SelenofQ9ERR7 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SelenofQ9ERR7 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SelenofQ9ERR7 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms