Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERH8

Slc28a3, Solute carrier family 28 member 3, mousemouse

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc28a3Q9ERH8 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Slc28a3Q9ERH8 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Slc28a3Q9ERH8 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
Slc28a3Q9ERH8 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Slc28a3Q9ERH8 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Slc28a3Q9ERH8 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Slc28a3Q9ERH8 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Slc28a3Q9ERH8 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Slc28a3Q9ERH8 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Slc28a3Q9ERH8 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Slc28a3Q9ERH8 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Slc28a3Q9ERH8 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Slc28a3Q9ERH8 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Slc28a3Q9ERH8 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Slc28a3Q9ERH8 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Slc28a3Q9ERH8 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Slc28a3Q9ERH8 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Slc28a3Q9ERH8 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Slc28a3Q9ERH8 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Slc28a3Q9ERH8 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Slc28a3Q9ERH8 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Slc28a3Q9ERH8 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Slc28a3Q9ERH8 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Slc28a3Q9ERH8 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Slc28a3Q9ERH8 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Slc28a3Q9ERH8 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Slc28a3Q9ERH8 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Slc28a3Q9ERH8 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Slc28a3Q9ERH8 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Slc28a3Q9ERH8 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Slc28a3Q9ERH8 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Slc28a3Q9ERH8 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Slc28a3Q9ERH8 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Slc28a3Q9ERH8 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Slc28a3Q9ERH8 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Slc28a3Q9ERH8 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Slc28a3Q9ERH8 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Slc28a3Q9ERH8 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Slc28a3Q9ERH8 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Slc28a3Q9ERH8 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Slc28a3Q9ERH8 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Slc28a3Q9ERH8 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Slc28a3Q9ERH8 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Slc28a3Q9ERH8 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Slc28a3Q9ERH8 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Slc28a3Q9ERH8 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Slc28a3Q9ERH8 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Slc28a3Q9ERH8 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Slc28a3Q9ERH8 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Slc28a3Q9ERH8 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Slc28a3Q9ERH8 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Slc28a3Q9ERH8 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Slc28a3Q9ERH8 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Slc28a3Q9ERH8 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Slc28a3Q9ERH8 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Slc28a3Q9ERH8 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Slc28a3Q9ERH8 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Slc28a3Q9ERH8 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Slc28a3Q9ERH8 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Slc28a3Q9ERH8 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Slc28a3Q9ERH8 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Slc28a3Q9ERH8 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Slc28a3Q9ERH8 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Slc28a3Q9ERH8 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Slc28a3Q9ERH8 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Slc28a3Q9ERH8 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Slc28a3Q9ERH8 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Slc28a3Q9ERH8 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Slc28a3Q9ERH8 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Slc28a3Q9ERH8 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Slc28a3Q9ERH8 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Slc28a3Q9ERH8 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Slc28a3Q9ERH8 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Slc28a3Q9ERH8 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Slc28a3Q9ERH8 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Slc28a3Q9ERH8 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Slc28a3Q9ERH8 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Slc28a3Q9ERH8 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Slc28a3Q9ERH8 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Slc28a3Q9ERH8 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Slc28a3Q9ERH8 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Slc28a3Q9ERH8 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Slc28a3Q9ERH8 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Slc28a3Q9ERH8 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Slc28a3Q9ERH8 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Slc28a3Q9ERH8 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Slc28a3Q9ERH8 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Slc28a3Q9ERH8 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Slc28a3Q9ERH8 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Slc28a3Q9ERH8 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Slc28a3Q9ERH8 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Slc28a3Q9ERH8 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Slc28a3Q9ERH8 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Slc28a3Q9ERH8 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Slc28a3Q9ERH8 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Slc28a3Q9ERH8 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Slc28a3Q9ERH8 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Slc28a3Q9ERH8 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Slc28a3Q9ERH8 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Slc28a3Q9ERH8 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms