Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER75

Irx6, Iroquois-class homeodomain protein IRX-6, mousemouse

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx6Q9ER75 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC32.96■■■□□ 2.87
Irx6Q9ER75 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC32.95■■■□□ 2.87
Irx6Q9ER75 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.89■■■□□ 2.86
Irx6Q9ER75 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Irx6Q9ER75 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Irx6Q9ER75 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC32.87■■■□□ 2.85
Irx6Q9ER75 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Irx6Q9ER75 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Irx6Q9ER75 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Irx6Q9ER75 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC32.85■■■□□ 2.85
Irx6Q9ER75 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Irx6Q9ER75 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Irx6Q9ER75 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Irx6Q9ER75 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Irx6Q9ER75 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.84■■■□□ 2.85
Irx6Q9ER75 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Irx6Q9ER75 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.85
Irx6Q9ER75 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.84
Irx6Q9ER75 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Irx6Q9ER75 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Irx6Q9ER75 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Irx6Q9ER75 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Irx6Q9ER75 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Irx6Q9ER75 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Irx6Q9ER75 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Irx6Q9ER75 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Irx6Q9ER75 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.77■■■□□ 2.84
Irx6Q9ER75 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
Irx6Q9ER75 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
Irx6Q9ER75 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC32.75■■■□□ 2.83
Irx6Q9ER75 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
Irx6Q9ER75 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Irx6Q9ER75 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Irx6Q9ER75 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Irx6Q9ER75 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Irx6Q9ER75 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
Irx6Q9ER75 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
Irx6Q9ER75 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Irx6Q9ER75 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Irx6Q9ER75 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC32.68■■■□□ 2.82
Irx6Q9ER75 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Irx6Q9ER75 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
Irx6Q9ER75 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Irx6Q9ER75 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC32.62■■■□□ 2.81
Irx6Q9ER75 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC32.62■■■□□ 2.81
Irx6Q9ER75 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC32.6■■■□□ 2.81
Irx6Q9ER75 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Irx6Q9ER75 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC32.59■■■□□ 2.81
Irx6Q9ER75 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Irx6Q9ER75 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC32.56■■■□□ 2.8
Irx6Q9ER75 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.55■■■□□ 2.8
Irx6Q9ER75 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC32.55■■■□□ 2.8
Irx6Q9ER75 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Irx6Q9ER75 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Irx6Q9ER75 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
Irx6Q9ER75 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC32.5■■■□□ 2.79
Irx6Q9ER75 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Irx6Q9ER75 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Irx6Q9ER75 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC32.49■■■□□ 2.79
Irx6Q9ER75 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Irx6Q9ER75 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Irx6Q9ER75 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
Irx6Q9ER75 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Irx6Q9ER75 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
Irx6Q9ER75 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.79
Irx6Q9ER75 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
Irx6Q9ER75 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Irx6Q9ER75 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Irx6Q9ER75 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
Irx6Q9ER75 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC32.35■■■□□ 2.77
Irx6Q9ER75 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
Irx6Q9ER75 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Irx6Q9ER75 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Irx6Q9ER75 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC32.32■■■□□ 2.76
Irx6Q9ER75 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Irx6Q9ER75 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC32.31■■■□□ 2.76
Irx6Q9ER75 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Irx6Q9ER75 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Irx6Q9ER75 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
Irx6Q9ER75 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Irx6Q9ER75 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Irx6Q9ER75 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Irx6Q9ER75 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Irx6Q9ER75 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Irx6Q9ER75 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
Irx6Q9ER75 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
Irx6Q9ER75 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC32.24■■■□□ 2.75
Irx6Q9ER75 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Irx6Q9ER75 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC32.23■■■□□ 2.75
Irx6Q9ER75 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Irx6Q9ER75 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Irx6Q9ER75 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Irx6Q9ER75 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
Irx6Q9ER75 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Irx6Q9ER75 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Irx6Q9ER75 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Irx6Q9ER75 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Irx6Q9ER75 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC32.17■■■□□ 2.74
Irx6Q9ER75 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
Irx6Q9ER75 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms