Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER56

Capn12, Calpain-12, mousemouse

Predictions only

Length 720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn12Q9ER56 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Capn12Q9ER56 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Capn12Q9ER56 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Capn12Q9ER56 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Capn12Q9ER56 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Capn12Q9ER56 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Capn12Q9ER56 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Capn12Q9ER56 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Capn12Q9ER56 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Capn12Q9ER56 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Capn12Q9ER56 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Capn12Q9ER56 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Capn12Q9ER56 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Capn12Q9ER56 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Capn12Q9ER56 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Capn12Q9ER56 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Capn12Q9ER56 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Capn12Q9ER56 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Capn12Q9ER56 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Capn12Q9ER56 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Capn12Q9ER56 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Capn12Q9ER56 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Capn12Q9ER56 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Capn12Q9ER56 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Capn12Q9ER56 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Capn12Q9ER56 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Capn12Q9ER56 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Capn12Q9ER56 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Capn12Q9ER56 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Capn12Q9ER56 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Capn12Q9ER56 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Capn12Q9ER56 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Capn12Q9ER56 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Capn12Q9ER56 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Capn12Q9ER56 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Capn12Q9ER56 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Capn12Q9ER56 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Capn12Q9ER56 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Capn12Q9ER56 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Capn12Q9ER56 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Capn12Q9ER56 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Capn12Q9ER56 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Capn12Q9ER56 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Capn12Q9ER56 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Capn12Q9ER56 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Capn12Q9ER56 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Capn12Q9ER56 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Capn12Q9ER56 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Capn12Q9ER56 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Capn12Q9ER56 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Capn12Q9ER56 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Capn12Q9ER56 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Capn12Q9ER56 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Capn12Q9ER56 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Capn12Q9ER56 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Capn12Q9ER56 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Capn12Q9ER56 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Capn12Q9ER56 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Capn12Q9ER56 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Capn12Q9ER56 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Capn12Q9ER56 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Capn12Q9ER56 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Capn12Q9ER56 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Capn12Q9ER56 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Capn12Q9ER56 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Capn12Q9ER56 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Capn12Q9ER56 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Capn12Q9ER56 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Capn12Q9ER56 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Capn12Q9ER56 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Capn12Q9ER56 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Capn12Q9ER56 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Capn12Q9ER56 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Capn12Q9ER56 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Capn12Q9ER56 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Capn12Q9ER56 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Capn12Q9ER56 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Capn12Q9ER56 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Capn12Q9ER56 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Capn12Q9ER56 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Capn12Q9ER56 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Capn12Q9ER56 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Capn12Q9ER56 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Capn12Q9ER56 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Capn12Q9ER56 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Capn12Q9ER56 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Capn12Q9ER56 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Capn12Q9ER56 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Capn12Q9ER56 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Capn12Q9ER56 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Capn12Q9ER56 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Capn12Q9ER56 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Capn12Q9ER56 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Capn12Q9ER56 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Capn12Q9ER56 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Capn12Q9ER56 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Capn12Q9ER56 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Capn12Q9ER56 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Capn12Q9ER56 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Capn12Q9ER56 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms