Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQC0

Chst1, Carbohydrate sulfotransferase 1, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chst1Q9EQC0 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Chst1Q9EQC0 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Chst1Q9EQC0 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Chst1Q9EQC0 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Chst1Q9EQC0 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Chst1Q9EQC0 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Chst1Q9EQC0 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Chst1Q9EQC0 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Chst1Q9EQC0 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Chst1Q9EQC0 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Chst1Q9EQC0 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Chst1Q9EQC0 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Chst1Q9EQC0 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Chst1Q9EQC0 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Chst1Q9EQC0 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Chst1Q9EQC0 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Chst1Q9EQC0 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Chst1Q9EQC0 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Chst1Q9EQC0 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Chst1Q9EQC0 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Chst1Q9EQC0 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Chst1Q9EQC0 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Chst1Q9EQC0 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Chst1Q9EQC0 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Chst1Q9EQC0 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Chst1Q9EQC0 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Chst1Q9EQC0 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Chst1Q9EQC0 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Chst1Q9EQC0 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Chst1Q9EQC0 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Chst1Q9EQC0 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Chst1Q9EQC0 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Chst1Q9EQC0 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Chst1Q9EQC0 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Chst1Q9EQC0 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Chst1Q9EQC0 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Chst1Q9EQC0 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Chst1Q9EQC0 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Chst1Q9EQC0 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Chst1Q9EQC0 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Chst1Q9EQC0 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Chst1Q9EQC0 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Chst1Q9EQC0 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Chst1Q9EQC0 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Chst1Q9EQC0 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Chst1Q9EQC0 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Chst1Q9EQC0 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Chst1Q9EQC0 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Chst1Q9EQC0 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Chst1Q9EQC0 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Chst1Q9EQC0 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Chst1Q9EQC0 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Chst1Q9EQC0 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Chst1Q9EQC0 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Chst1Q9EQC0 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Chst1Q9EQC0 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Chst1Q9EQC0 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Chst1Q9EQC0 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Chst1Q9EQC0 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Chst1Q9EQC0 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Chst1Q9EQC0 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Chst1Q9EQC0 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Chst1Q9EQC0 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Chst1Q9EQC0 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Chst1Q9EQC0 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Chst1Q9EQC0 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Chst1Q9EQC0 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Chst1Q9EQC0 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Chst1Q9EQC0 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Chst1Q9EQC0 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Chst1Q9EQC0 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Chst1Q9EQC0 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Chst1Q9EQC0 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Chst1Q9EQC0 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Chst1Q9EQC0 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Chst1Q9EQC0 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Chst1Q9EQC0 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Chst1Q9EQC0 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Chst1Q9EQC0 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Chst1Q9EQC0 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Chst1Q9EQC0 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Chst1Q9EQC0 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Chst1Q9EQC0 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Chst1Q9EQC0 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Chst1Q9EQC0 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Chst1Q9EQC0 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Chst1Q9EQC0 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Chst1Q9EQC0 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Chst1Q9EQC0 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Chst1Q9EQC0 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Chst1Q9EQC0 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Chst1Q9EQC0 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Chst1Q9EQC0 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Chst1Q9EQC0 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Chst1Q9EQC0 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Chst1Q9EQC0 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Chst1Q9EQC0 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Chst1Q9EQC0 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Chst1Q9EQC0 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Chst1Q9EQC0 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms