Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPU5

Tnfrsf21, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 21, mousemouse

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf21Q9EPU5 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tnfrsf21Q9EPU5 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tnfrsf21Q9EPU5 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tnfrsf21Q9EPU5 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tnfrsf21Q9EPU5 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tnfrsf21Q9EPU5 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tnfrsf21Q9EPU5 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tnfrsf21Q9EPU5 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tnfrsf21Q9EPU5 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tnfrsf21Q9EPU5 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tnfrsf21Q9EPU5 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tnfrsf21Q9EPU5 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tnfrsf21Q9EPU5 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tnfrsf21Q9EPU5 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Tnfrsf21Q9EPU5 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tnfrsf21Q9EPU5 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tnfrsf21Q9EPU5 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tnfrsf21Q9EPU5 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tnfrsf21Q9EPU5 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tnfrsf21Q9EPU5 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tnfrsf21Q9EPU5 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tnfrsf21Q9EPU5 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tnfrsf21Q9EPU5 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tnfrsf21Q9EPU5 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tnfrsf21Q9EPU5 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tnfrsf21Q9EPU5 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tnfrsf21Q9EPU5 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tnfrsf21Q9EPU5 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tnfrsf21Q9EPU5 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tnfrsf21Q9EPU5 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tnfrsf21Q9EPU5 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tnfrsf21Q9EPU5 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Tnfrsf21Q9EPU5 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Tnfrsf21Q9EPU5 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Tnfrsf21Q9EPU5 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Tnfrsf21Q9EPU5 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Tnfrsf21Q9EPU5 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tnfrsf21Q9EPU5 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tnfrsf21Q9EPU5 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tnfrsf21Q9EPU5 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tnfrsf21Q9EPU5 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tnfrsf21Q9EPU5 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tnfrsf21Q9EPU5 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tnfrsf21Q9EPU5 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tnfrsf21Q9EPU5 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tnfrsf21Q9EPU5 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tnfrsf21Q9EPU5 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tnfrsf21Q9EPU5 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tnfrsf21Q9EPU5 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tnfrsf21Q9EPU5 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tnfrsf21Q9EPU5 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tnfrsf21Q9EPU5 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tnfrsf21Q9EPU5 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tnfrsf21Q9EPU5 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tnfrsf21Q9EPU5 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tnfrsf21Q9EPU5 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Tnfrsf21Q9EPU5 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tnfrsf21Q9EPU5 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tnfrsf21Q9EPU5 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tnfrsf21Q9EPU5 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Tnfrsf21Q9EPU5 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tnfrsf21Q9EPU5 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tnfrsf21Q9EPU5 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Tnfrsf21Q9EPU5 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Tnfrsf21Q9EPU5 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tnfrsf21Q9EPU5 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tnfrsf21Q9EPU5 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tnfrsf21Q9EPU5 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Tnfrsf21Q9EPU5 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tnfrsf21Q9EPU5 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Tnfrsf21Q9EPU5 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tnfrsf21Q9EPU5 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tnfrsf21Q9EPU5 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tnfrsf21Q9EPU5 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tnfrsf21Q9EPU5 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tnfrsf21Q9EPU5 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tnfrsf21Q9EPU5 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tnfrsf21Q9EPU5 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tnfrsf21Q9EPU5 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tnfrsf21Q9EPU5 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tnfrsf21Q9EPU5 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tnfrsf21Q9EPU5 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tnfrsf21Q9EPU5 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tnfrsf21Q9EPU5 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tnfrsf21Q9EPU5 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tnfrsf21Q9EPU5 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tnfrsf21Q9EPU5 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tnfrsf21Q9EPU5 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tnfrsf21Q9EPU5 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tnfrsf21Q9EPU5 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tnfrsf21Q9EPU5 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tnfrsf21Q9EPU5 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tnfrsf21Q9EPU5 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Tnfrsf21Q9EPU5 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tnfrsf21Q9EPU5 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tnfrsf21Q9EPU5 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tnfrsf21Q9EPU5 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tnfrsf21Q9EPU5 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tnfrsf21Q9EPU5 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tnfrsf21Q9EPU5 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.8 ms