Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCH4

Eif3f, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit F, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3fQ9DCH4 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Eif3fQ9DCH4 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Eif3fQ9DCH4 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Eif3fQ9DCH4 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Eif3fQ9DCH4 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Eif3fQ9DCH4 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Eif3fQ9DCH4 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Eif3fQ9DCH4 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Eif3fQ9DCH4 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Eif3fQ9DCH4 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Eif3fQ9DCH4 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Eif3fQ9DCH4 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Eif3fQ9DCH4 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Eif3fQ9DCH4 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Eif3fQ9DCH4 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Eif3fQ9DCH4 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Eif3fQ9DCH4 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Eif3fQ9DCH4 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Eif3fQ9DCH4 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Eif3fQ9DCH4 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Eif3fQ9DCH4 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Eif3fQ9DCH4 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Eif3fQ9DCH4 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Eif3fQ9DCH4 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Eif3fQ9DCH4 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Eif3fQ9DCH4 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Eif3fQ9DCH4 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Eif3fQ9DCH4 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Eif3fQ9DCH4 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Eif3fQ9DCH4 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Eif3fQ9DCH4 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Eif3fQ9DCH4 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Eif3fQ9DCH4 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Eif3fQ9DCH4 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Eif3fQ9DCH4 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Eif3fQ9DCH4 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Eif3fQ9DCH4 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Eif3fQ9DCH4 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Eif3fQ9DCH4 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Eif3fQ9DCH4 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Eif3fQ9DCH4 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Eif3fQ9DCH4 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Eif3fQ9DCH4 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Eif3fQ9DCH4 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Eif3fQ9DCH4 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Eif3fQ9DCH4 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Eif3fQ9DCH4 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Eif3fQ9DCH4 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Eif3fQ9DCH4 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Eif3fQ9DCH4 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Eif3fQ9DCH4 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Eif3fQ9DCH4 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Eif3fQ9DCH4 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Eif3fQ9DCH4 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Eif3fQ9DCH4 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Eif3fQ9DCH4 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Eif3fQ9DCH4 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Eif3fQ9DCH4 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Eif3fQ9DCH4 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Eif3fQ9DCH4 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Eif3fQ9DCH4 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Eif3fQ9DCH4 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Eif3fQ9DCH4 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Eif3fQ9DCH4 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Eif3fQ9DCH4 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Eif3fQ9DCH4 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Eif3fQ9DCH4 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Eif3fQ9DCH4 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Eif3fQ9DCH4 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Eif3fQ9DCH4 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Eif3fQ9DCH4 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Eif3fQ9DCH4 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Eif3fQ9DCH4 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Eif3fQ9DCH4 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Eif3fQ9DCH4 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Eif3fQ9DCH4 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Eif3fQ9DCH4 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Eif3fQ9DCH4 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Eif3fQ9DCH4 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Eif3fQ9DCH4 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Eif3fQ9DCH4 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Eif3fQ9DCH4 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Eif3fQ9DCH4 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Eif3fQ9DCH4 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Eif3fQ9DCH4 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Eif3fQ9DCH4 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Eif3fQ9DCH4 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Eif3fQ9DCH4 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Eif3fQ9DCH4 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Eif3fQ9DCH4 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Eif3fQ9DCH4 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Eif3fQ9DCH4 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Eif3fQ9DCH4 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Eif3fQ9DCH4 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Eif3fQ9DCH4 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Eif3fQ9DCH4 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Eif3fQ9DCH4 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Eif3fQ9DCH4 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Eif3fQ9DCH4 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Eif3fQ9DCH4 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.5 ms