Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBR4

Apbb2, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family B member 2, mousemouse

Predictions only

Length 760 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apbb2Q9DBR4 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Apbb2Q9DBR4 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Apbb2Q9DBR4 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Apbb2Q9DBR4 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Apbb2Q9DBR4 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Apbb2Q9DBR4 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Apbb2Q9DBR4 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Apbb2Q9DBR4 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Apbb2Q9DBR4 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Apbb2Q9DBR4 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Apbb2Q9DBR4 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Apbb2Q9DBR4 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Apbb2Q9DBR4 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Apbb2Q9DBR4 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Apbb2Q9DBR4 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Apbb2Q9DBR4 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Apbb2Q9DBR4 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Apbb2Q9DBR4 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Apbb2Q9DBR4 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Apbb2Q9DBR4 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Apbb2Q9DBR4 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Apbb2Q9DBR4 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Apbb2Q9DBR4 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Apbb2Q9DBR4 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Apbb2Q9DBR4 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Apbb2Q9DBR4 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Apbb2Q9DBR4 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Apbb2Q9DBR4 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Apbb2Q9DBR4 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Apbb2Q9DBR4 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Apbb2Q9DBR4 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Apbb2Q9DBR4 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Apbb2Q9DBR4 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Apbb2Q9DBR4 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
Apbb2Q9DBR4 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Apbb2Q9DBR4 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Apbb2Q9DBR4 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Apbb2Q9DBR4 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Apbb2Q9DBR4 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Apbb2Q9DBR4 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Apbb2Q9DBR4 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Apbb2Q9DBR4 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Apbb2Q9DBR4 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Apbb2Q9DBR4 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Apbb2Q9DBR4 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Apbb2Q9DBR4 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Apbb2Q9DBR4 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Apbb2Q9DBR4 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Apbb2Q9DBR4 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Apbb2Q9DBR4 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Apbb2Q9DBR4 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Apbb2Q9DBR4 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Apbb2Q9DBR4 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Apbb2Q9DBR4 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Apbb2Q9DBR4 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Apbb2Q9DBR4 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Apbb2Q9DBR4 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Apbb2Q9DBR4 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Apbb2Q9DBR4 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Apbb2Q9DBR4 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Apbb2Q9DBR4 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Apbb2Q9DBR4 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Apbb2Q9DBR4 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Apbb2Q9DBR4 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Apbb2Q9DBR4 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Apbb2Q9DBR4 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Apbb2Q9DBR4 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Apbb2Q9DBR4 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Apbb2Q9DBR4 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Apbb2Q9DBR4 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Apbb2Q9DBR4 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Apbb2Q9DBR4 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Apbb2Q9DBR4 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Apbb2Q9DBR4 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Apbb2Q9DBR4 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Apbb2Q9DBR4 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Apbb2Q9DBR4 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Apbb2Q9DBR4 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Apbb2Q9DBR4 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Apbb2Q9DBR4 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Apbb2Q9DBR4 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Apbb2Q9DBR4 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Apbb2Q9DBR4 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Apbb2Q9DBR4 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Apbb2Q9DBR4 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Apbb2Q9DBR4 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Apbb2Q9DBR4 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Apbb2Q9DBR4 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Apbb2Q9DBR4 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Apbb2Q9DBR4 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Apbb2Q9DBR4 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Apbb2Q9DBR4 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Apbb2Q9DBR4 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Apbb2Q9DBR4 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Apbb2Q9DBR4 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Apbb2Q9DBR4 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Apbb2Q9DBR4 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Apbb2Q9DBR4 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Apbb2Q9DBR4 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Apbb2Q9DBR4 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms