Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB60

Fam213b, Prostamide/prostaglandin F synthase, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam213bQ9DB60 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Fam213bQ9DB60 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Fam213bQ9DB60 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Fam213bQ9DB60 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Fam213bQ9DB60 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Fam213bQ9DB60 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Fam213bQ9DB60 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Fam213bQ9DB60 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Fam213bQ9DB60 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Fam213bQ9DB60 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Fam213bQ9DB60 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Fam213bQ9DB60 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Fam213bQ9DB60 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Fam213bQ9DB60 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Fam213bQ9DB60 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Fam213bQ9DB60 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Fam213bQ9DB60 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Fam213bQ9DB60 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Fam213bQ9DB60 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Fam213bQ9DB60 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Fam213bQ9DB60 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Fam213bQ9DB60 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Fam213bQ9DB60 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Fam213bQ9DB60 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fam213bQ9DB60 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fam213bQ9DB60 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fam213bQ9DB60 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fam213bQ9DB60 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fam213bQ9DB60 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fam213bQ9DB60 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fam213bQ9DB60 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fam213bQ9DB60 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fam213bQ9DB60 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Fam213bQ9DB60 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fam213bQ9DB60 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fam213bQ9DB60 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fam213bQ9DB60 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fam213bQ9DB60 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fam213bQ9DB60 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fam213bQ9DB60 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fam213bQ9DB60 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fam213bQ9DB60 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fam213bQ9DB60 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fam213bQ9DB60 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fam213bQ9DB60 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fam213bQ9DB60 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fam213bQ9DB60 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fam213bQ9DB60 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Fam213bQ9DB60 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fam213bQ9DB60 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fam213bQ9DB60 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fam213bQ9DB60 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fam213bQ9DB60 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fam213bQ9DB60 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fam213bQ9DB60 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fam213bQ9DB60 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fam213bQ9DB60 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fam213bQ9DB60 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fam213bQ9DB60 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fam213bQ9DB60 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fam213bQ9DB60 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fam213bQ9DB60 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fam213bQ9DB60 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fam213bQ9DB60 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fam213bQ9DB60 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fam213bQ9DB60 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Fam213bQ9DB60 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fam213bQ9DB60 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fam213bQ9DB60 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fam213bQ9DB60 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fam213bQ9DB60 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fam213bQ9DB60 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Fam213bQ9DB60 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Fam213bQ9DB60 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Fam213bQ9DB60 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Fam213bQ9DB60 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Fam213bQ9DB60 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Fam213bQ9DB60 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Fam213bQ9DB60 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fam213bQ9DB60 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fam213bQ9DB60 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fam213bQ9DB60 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fam213bQ9DB60 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fam213bQ9DB60 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fam213bQ9DB60 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fam213bQ9DB60 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fam213bQ9DB60 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fam213bQ9DB60 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fam213bQ9DB60 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fam213bQ9DB60 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fam213bQ9DB60 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fam213bQ9DB60 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fam213bQ9DB60 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fam213bQ9DB60 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fam213bQ9DB60 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fam213bQ9DB60 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fam213bQ9DB60 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fam213bQ9DB60 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fam213bQ9DB60 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fam213bQ9DB60 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms