Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M2

Usp12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 12, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp12Q9D9M2 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Usp12Q9D9M2 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Usp12Q9D9M2 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Usp12Q9D9M2 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Usp12Q9D9M2 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Usp12Q9D9M2 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Usp12Q9D9M2 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Usp12Q9D9M2 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Usp12Q9D9M2 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Usp12Q9D9M2 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Usp12Q9D9M2 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Usp12Q9D9M2 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Usp12Q9D9M2 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Usp12Q9D9M2 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Usp12Q9D9M2 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Usp12Q9D9M2 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Usp12Q9D9M2 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Usp12Q9D9M2 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Usp12Q9D9M2 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Usp12Q9D9M2 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Usp12Q9D9M2 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Usp12Q9D9M2 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Usp12Q9D9M2 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Usp12Q9D9M2 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Usp12Q9D9M2 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Usp12Q9D9M2 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Usp12Q9D9M2 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Usp12Q9D9M2 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Usp12Q9D9M2 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Usp12Q9D9M2 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Usp12Q9D9M2 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Usp12Q9D9M2 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Usp12Q9D9M2 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Usp12Q9D9M2 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Usp12Q9D9M2 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Usp12Q9D9M2 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Usp12Q9D9M2 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Usp12Q9D9M2 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Usp12Q9D9M2 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Usp12Q9D9M2 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Usp12Q9D9M2 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Usp12Q9D9M2 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Usp12Q9D9M2 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Usp12Q9D9M2 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Usp12Q9D9M2 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Usp12Q9D9M2 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Usp12Q9D9M2 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Usp12Q9D9M2 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Usp12Q9D9M2 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Usp12Q9D9M2 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Usp12Q9D9M2 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Usp12Q9D9M2 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Usp12Q9D9M2 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Usp12Q9D9M2 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Usp12Q9D9M2 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Usp12Q9D9M2 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Usp12Q9D9M2 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Usp12Q9D9M2 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Usp12Q9D9M2 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Usp12Q9D9M2 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Usp12Q9D9M2 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Usp12Q9D9M2 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Usp12Q9D9M2 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Usp12Q9D9M2 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Usp12Q9D9M2 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Usp12Q9D9M2 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Usp12Q9D9M2 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Usp12Q9D9M2 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Usp12Q9D9M2 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Usp12Q9D9M2 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Usp12Q9D9M2 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Usp12Q9D9M2 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Usp12Q9D9M2 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Usp12Q9D9M2 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Usp12Q9D9M2 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Usp12Q9D9M2 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Usp12Q9D9M2 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Usp12Q9D9M2 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Usp12Q9D9M2 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Usp12Q9D9M2 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Usp12Q9D9M2 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Usp12Q9D9M2 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Usp12Q9D9M2 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Usp12Q9D9M2 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Usp12Q9D9M2 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Usp12Q9D9M2 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Usp12Q9D9M2 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Usp12Q9D9M2 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Usp12Q9D9M2 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Usp12Q9D9M2 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Usp12Q9D9M2 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Usp12Q9D9M2 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Usp12Q9D9M2 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Usp12Q9D9M2 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Usp12Q9D9M2 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Usp12Q9D9M2 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Usp12Q9D9M2 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Usp12Q9D9M2 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Usp12Q9D9M2 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Usp12Q9D9M2 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms