Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9C7

Uncharacterized protein C3orf62 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 252 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D9C7 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Q9D9C7 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Q9D9C7 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Q9D9C7 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Q9D9C7 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Q9D9C7 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Q9D9C7 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Q9D9C7 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Q9D9C7 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Q9D9C7 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Q9D9C7 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Q9D9C7 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Q9D9C7 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Q9D9C7 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Q9D9C7 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Q9D9C7 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Q9D9C7 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Q9D9C7 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Q9D9C7 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Q9D9C7 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Q9D9C7 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Q9D9C7 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Q9D9C7 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Q9D9C7 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Q9D9C7 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Q9D9C7 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Q9D9C7 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Q9D9C7 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Q9D9C7 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Q9D9C7 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Q9D9C7 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Q9D9C7 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Q9D9C7 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Q9D9C7 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Q9D9C7 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Q9D9C7 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Q9D9C7 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Q9D9C7 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Q9D9C7 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Q9D9C7 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Q9D9C7 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Q9D9C7 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Q9D9C7 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Q9D9C7 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Q9D9C7 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Q9D9C7 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Q9D9C7 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Q9D9C7 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Q9D9C7 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Q9D9C7 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Q9D9C7 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Q9D9C7 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Q9D9C7 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Q9D9C7 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Q9D9C7 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Q9D9C7 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Q9D9C7 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Q9D9C7 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Q9D9C7 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Q9D9C7 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Q9D9C7 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Q9D9C7 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Q9D9C7 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Q9D9C7 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Q9D9C7 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Q9D9C7 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Q9D9C7 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Q9D9C7 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Q9D9C7 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Q9D9C7 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Q9D9C7 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Q9D9C7 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Q9D9C7 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Q9D9C7 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Q9D9C7 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Q9D9C7 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Q9D9C7 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Q9D9C7 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Q9D9C7 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Q9D9C7 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Q9D9C7 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Q9D9C7 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Q9D9C7 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Q9D9C7 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Q9D9C7 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Q9D9C7 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Q9D9C7 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Q9D9C7 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Q9D9C7 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Q9D9C7 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Q9D9C7 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Q9D9C7 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Q9D9C7 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Q9D9C7 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Q9D9C7 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Q9D9C7 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Q9D9C7 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Q9D9C7 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Q9D9C7 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Q9D9C7 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms