Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9C7

Uncharacterized protein C3orf62 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 252 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D9C7 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Q9D9C7 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Q9D9C7 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Q9D9C7 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Q9D9C7 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Q9D9C7 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Q9D9C7 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Q9D9C7 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Q9D9C7 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Q9D9C7 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Q9D9C7 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Q9D9C7 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Q9D9C7 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Q9D9C7 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Q9D9C7 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Q9D9C7 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Q9D9C7 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Q9D9C7 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Q9D9C7 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Q9D9C7 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Q9D9C7 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Q9D9C7 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Q9D9C7 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Q9D9C7 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Q9D9C7 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Q9D9C7 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Q9D9C7 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Q9D9C7 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Q9D9C7 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Q9D9C7 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Q9D9C7 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Q9D9C7 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Q9D9C7 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Q9D9C7 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Q9D9C7 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Q9D9C7 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Q9D9C7 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Q9D9C7 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Q9D9C7 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Q9D9C7 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Q9D9C7 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Q9D9C7 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Q9D9C7 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Q9D9C7 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Q9D9C7 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Q9D9C7 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Q9D9C7 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Q9D9C7 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Q9D9C7 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Q9D9C7 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Q9D9C7 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Q9D9C7 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Q9D9C7 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Q9D9C7 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Q9D9C7 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Q9D9C7 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Q9D9C7 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Q9D9C7 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Q9D9C7 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Q9D9C7 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Q9D9C7 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Q9D9C7 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Q9D9C7 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Q9D9C7 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Q9D9C7 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Q9D9C7 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Q9D9C7 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Q9D9C7 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Q9D9C7 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Q9D9C7 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Q9D9C7 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Q9D9C7 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Q9D9C7 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Q9D9C7 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Q9D9C7 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Q9D9C7 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Q9D9C7 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Q9D9C7 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Q9D9C7 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Q9D9C7 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Q9D9C7 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Q9D9C7 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Q9D9C7 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Q9D9C7 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Q9D9C7 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Q9D9C7 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Q9D9C7 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Q9D9C7 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Q9D9C7 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Q9D9C7 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Q9D9C7 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Q9D9C7 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Q9D9C7 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Q9D9C7 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Q9D9C7 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Q9D9C7 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Q9D9C7 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Q9D9C7 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Q9D9C7 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Q9D9C7 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms