Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8W5

Psmd12, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 12, mousemouse

Predictions only

Length 456 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmd12Q9D8W5 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Psmd12Q9D8W5 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Psmd12Q9D8W5 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Psmd12Q9D8W5 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Psmd12Q9D8W5 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Psmd12Q9D8W5 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Psmd12Q9D8W5 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Psmd12Q9D8W5 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Psmd12Q9D8W5 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Psmd12Q9D8W5 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Psmd12Q9D8W5 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Psmd12Q9D8W5 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Psmd12Q9D8W5 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Psmd12Q9D8W5 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Psmd12Q9D8W5 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Psmd12Q9D8W5 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Psmd12Q9D8W5 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Psmd12Q9D8W5 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Psmd12Q9D8W5 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Psmd12Q9D8W5 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Psmd12Q9D8W5 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Psmd12Q9D8W5 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Psmd12Q9D8W5 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Psmd12Q9D8W5 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Psmd12Q9D8W5 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Psmd12Q9D8W5 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Psmd12Q9D8W5 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Psmd12Q9D8W5 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Psmd12Q9D8W5 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Psmd12Q9D8W5 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Psmd12Q9D8W5 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Psmd12Q9D8W5 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Psmd12Q9D8W5 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Psmd12Q9D8W5 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Psmd12Q9D8W5 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Psmd12Q9D8W5 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Psmd12Q9D8W5 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Psmd12Q9D8W5 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Psmd12Q9D8W5 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Psmd12Q9D8W5 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Psmd12Q9D8W5 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Psmd12Q9D8W5 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Psmd12Q9D8W5 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Psmd12Q9D8W5 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Psmd12Q9D8W5 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Psmd12Q9D8W5 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Psmd12Q9D8W5 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Psmd12Q9D8W5 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Psmd12Q9D8W5 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Psmd12Q9D8W5 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Psmd12Q9D8W5 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Psmd12Q9D8W5 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Psmd12Q9D8W5 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Psmd12Q9D8W5 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Psmd12Q9D8W5 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Psmd12Q9D8W5 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Psmd12Q9D8W5 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Psmd12Q9D8W5 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Psmd12Q9D8W5 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Psmd12Q9D8W5 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
Psmd12Q9D8W5 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Psmd12Q9D8W5 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Psmd12Q9D8W5 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Psmd12Q9D8W5 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Psmd12Q9D8W5 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Psmd12Q9D8W5 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Psmd12Q9D8W5 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Psmd12Q9D8W5 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Psmd12Q9D8W5 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Psmd12Q9D8W5 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Psmd12Q9D8W5 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Psmd12Q9D8W5 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Psmd12Q9D8W5 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Psmd12Q9D8W5 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Psmd12Q9D8W5 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Psmd12Q9D8W5 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Psmd12Q9D8W5 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Psmd12Q9D8W5 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Psmd12Q9D8W5 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Psmd12Q9D8W5 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Psmd12Q9D8W5 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Psmd12Q9D8W5 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Psmd12Q9D8W5 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Psmd12Q9D8W5 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Psmd12Q9D8W5 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Psmd12Q9D8W5 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Psmd12Q9D8W5 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Psmd12Q9D8W5 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Psmd12Q9D8W5 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Psmd12Q9D8W5 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Psmd12Q9D8W5 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Psmd12Q9D8W5 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Psmd12Q9D8W5 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Psmd12Q9D8W5 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Psmd12Q9D8W5 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Psmd12Q9D8W5 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Psmd12Q9D8W5 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Psmd12Q9D8W5 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Psmd12Q9D8W5 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Psmd12Q9D8W5 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.9 ms