Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8V0

Hm13, Minor histocompatibility antigen H13, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hm13Q9D8V0 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Hm13Q9D8V0 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Hm13Q9D8V0 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Hm13Q9D8V0 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Hm13Q9D8V0 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Hm13Q9D8V0 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Hm13Q9D8V0 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Hm13Q9D8V0 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Hm13Q9D8V0 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Hm13Q9D8V0 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Hm13Q9D8V0 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Hm13Q9D8V0 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Hm13Q9D8V0 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Hm13Q9D8V0 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Hm13Q9D8V0 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Hm13Q9D8V0 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Hm13Q9D8V0 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Hm13Q9D8V0 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Hm13Q9D8V0 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Hm13Q9D8V0 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Hm13Q9D8V0 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Hm13Q9D8V0 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Hm13Q9D8V0 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Hm13Q9D8V0 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Hm13Q9D8V0 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Hm13Q9D8V0 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Hm13Q9D8V0 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Hm13Q9D8V0 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Hm13Q9D8V0 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Hm13Q9D8V0 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Hm13Q9D8V0 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Hm13Q9D8V0 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Hm13Q9D8V0 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Hm13Q9D8V0 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Hm13Q9D8V0 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Hm13Q9D8V0 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Hm13Q9D8V0 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Hm13Q9D8V0 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Hm13Q9D8V0 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Hm13Q9D8V0 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Hm13Q9D8V0 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Hm13Q9D8V0 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Hm13Q9D8V0 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Hm13Q9D8V0 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Hm13Q9D8V0 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Hm13Q9D8V0 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Hm13Q9D8V0 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Hm13Q9D8V0 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Hm13Q9D8V0 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Hm13Q9D8V0 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Hm13Q9D8V0 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Hm13Q9D8V0 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Hm13Q9D8V0 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Hm13Q9D8V0 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Hm13Q9D8V0 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Hm13Q9D8V0 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Hm13Q9D8V0 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Hm13Q9D8V0 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Hm13Q9D8V0 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Hm13Q9D8V0 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Hm13Q9D8V0 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Hm13Q9D8V0 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Hm13Q9D8V0 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Hm13Q9D8V0 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Hm13Q9D8V0 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Hm13Q9D8V0 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Hm13Q9D8V0 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Hm13Q9D8V0 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Hm13Q9D8V0 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Hm13Q9D8V0 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Hm13Q9D8V0 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Hm13Q9D8V0 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Hm13Q9D8V0 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Hm13Q9D8V0 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Hm13Q9D8V0 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Hm13Q9D8V0 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Hm13Q9D8V0 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Hm13Q9D8V0 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Hm13Q9D8V0 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Hm13Q9D8V0 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Hm13Q9D8V0 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Hm13Q9D8V0 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Hm13Q9D8V0 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Hm13Q9D8V0 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Hm13Q9D8V0 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Hm13Q9D8V0 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Hm13Q9D8V0 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Hm13Q9D8V0 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Hm13Q9D8V0 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Hm13Q9D8V0 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Hm13Q9D8V0 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Hm13Q9D8V0 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Hm13Q9D8V0 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Hm13Q9D8V0 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Hm13Q9D8V0 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Hm13Q9D8V0 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Hm13Q9D8V0 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Hm13Q9D8V0 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Hm13Q9D8V0 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Hm13Q9D8V0 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 150.4 ms