Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7V1

Sh2d4a, SH2 domain-containing protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh2d4aQ9D7V1 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sh2d4aQ9D7V1 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sh2d4aQ9D7V1 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sh2d4aQ9D7V1 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sh2d4aQ9D7V1 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Sh2d4aQ9D7V1 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sh2d4aQ9D7V1 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sh2d4aQ9D7V1 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sh2d4aQ9D7V1 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sh2d4aQ9D7V1 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sh2d4aQ9D7V1 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Sh2d4aQ9D7V1 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sh2d4aQ9D7V1 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sh2d4aQ9D7V1 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sh2d4aQ9D7V1 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sh2d4aQ9D7V1 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sh2d4aQ9D7V1 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Sh2d4aQ9D7V1 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Sh2d4aQ9D7V1 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sh2d4aQ9D7V1 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sh2d4aQ9D7V1 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sh2d4aQ9D7V1 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sh2d4aQ9D7V1 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sh2d4aQ9D7V1 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sh2d4aQ9D7V1 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Sh2d4aQ9D7V1 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Sh2d4aQ9D7V1 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Sh2d4aQ9D7V1 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sh2d4aQ9D7V1 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sh2d4aQ9D7V1 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Sh2d4aQ9D7V1 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sh2d4aQ9D7V1 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sh2d4aQ9D7V1 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sh2d4aQ9D7V1 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sh2d4aQ9D7V1 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sh2d4aQ9D7V1 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sh2d4aQ9D7V1 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sh2d4aQ9D7V1 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sh2d4aQ9D7V1 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sh2d4aQ9D7V1 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Sh2d4aQ9D7V1 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Sh2d4aQ9D7V1 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sh2d4aQ9D7V1 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sh2d4aQ9D7V1 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sh2d4aQ9D7V1 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Sh2d4aQ9D7V1 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Sh2d4aQ9D7V1 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Sh2d4aQ9D7V1 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Sh2d4aQ9D7V1 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Sh2d4aQ9D7V1 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sh2d4aQ9D7V1 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sh2d4aQ9D7V1 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sh2d4aQ9D7V1 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sh2d4aQ9D7V1 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sh2d4aQ9D7V1 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sh2d4aQ9D7V1 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sh2d4aQ9D7V1 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sh2d4aQ9D7V1 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sh2d4aQ9D7V1 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sh2d4aQ9D7V1 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sh2d4aQ9D7V1 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sh2d4aQ9D7V1 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sh2d4aQ9D7V1 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sh2d4aQ9D7V1 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sh2d4aQ9D7V1 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Sh2d4aQ9D7V1 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sh2d4aQ9D7V1 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Sh2d4aQ9D7V1 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sh2d4aQ9D7V1 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Sh2d4aQ9D7V1 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Sh2d4aQ9D7V1 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Sh2d4aQ9D7V1 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Sh2d4aQ9D7V1 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Sh2d4aQ9D7V1 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Sh2d4aQ9D7V1 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Sh2d4aQ9D7V1 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Sh2d4aQ9D7V1 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sh2d4aQ9D7V1 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sh2d4aQ9D7V1 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sh2d4aQ9D7V1 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sh2d4aQ9D7V1 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sh2d4aQ9D7V1 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sh2d4aQ9D7V1 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Sh2d4aQ9D7V1 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Sh2d4aQ9D7V1 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Sh2d4aQ9D7V1 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Sh2d4aQ9D7V1 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Sh2d4aQ9D7V1 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Sh2d4aQ9D7V1 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Sh2d4aQ9D7V1 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Sh2d4aQ9D7V1 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Sh2d4aQ9D7V1 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Sh2d4aQ9D7V1 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sh2d4aQ9D7V1 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sh2d4aQ9D7V1 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sh2d4aQ9D7V1 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sh2d4aQ9D7V1 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Sh2d4aQ9D7V1 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Sh2d4aQ9D7V1 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Sh2d4aQ9D7V1 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms