Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6K8

Fundc2, FUN14 domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fundc2Q9D6K8 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Fundc2Q9D6K8 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Fundc2Q9D6K8 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Fundc2Q9D6K8 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Fundc2Q9D6K8 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Fundc2Q9D6K8 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Fundc2Q9D6K8 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Fundc2Q9D6K8 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Fundc2Q9D6K8 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Fundc2Q9D6K8 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Fundc2Q9D6K8 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Fundc2Q9D6K8 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Fundc2Q9D6K8 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Fundc2Q9D6K8 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Fundc2Q9D6K8 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Fundc2Q9D6K8 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Fundc2Q9D6K8 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Fundc2Q9D6K8 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Fundc2Q9D6K8 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Fundc2Q9D6K8 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Fundc2Q9D6K8 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Fundc2Q9D6K8 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Fundc2Q9D6K8 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Fundc2Q9D6K8 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Fundc2Q9D6K8 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Fundc2Q9D6K8 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Fundc2Q9D6K8 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Fundc2Q9D6K8 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Fundc2Q9D6K8 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Fundc2Q9D6K8 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Fundc2Q9D6K8 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Fundc2Q9D6K8 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Fundc2Q9D6K8 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Fundc2Q9D6K8 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Fundc2Q9D6K8 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Fundc2Q9D6K8 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Fundc2Q9D6K8 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Fundc2Q9D6K8 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Fundc2Q9D6K8 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Fundc2Q9D6K8 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Fundc2Q9D6K8 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Fundc2Q9D6K8 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Fundc2Q9D6K8 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Fundc2Q9D6K8 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Fundc2Q9D6K8 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Fundc2Q9D6K8 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Fundc2Q9D6K8 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Fundc2Q9D6K8 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Fundc2Q9D6K8 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Fundc2Q9D6K8 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Fundc2Q9D6K8 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Fundc2Q9D6K8 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Fundc2Q9D6K8 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fundc2Q9D6K8 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fundc2Q9D6K8 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fundc2Q9D6K8 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fundc2Q9D6K8 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fundc2Q9D6K8 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fundc2Q9D6K8 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fundc2Q9D6K8 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fundc2Q9D6K8 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fundc2Q9D6K8 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fundc2Q9D6K8 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fundc2Q9D6K8 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fundc2Q9D6K8 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fundc2Q9D6K8 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fundc2Q9D6K8 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fundc2Q9D6K8 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fundc2Q9D6K8 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fundc2Q9D6K8 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fundc2Q9D6K8 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fundc2Q9D6K8 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fundc2Q9D6K8 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Fundc2Q9D6K8 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fundc2Q9D6K8 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fundc2Q9D6K8 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fundc2Q9D6K8 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fundc2Q9D6K8 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fundc2Q9D6K8 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fundc2Q9D6K8 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fundc2Q9D6K8 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Fundc2Q9D6K8 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Fundc2Q9D6K8 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Fundc2Q9D6K8 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Fundc2Q9D6K8 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Fundc2Q9D6K8 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Fundc2Q9D6K8 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Fundc2Q9D6K8 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Fundc2Q9D6K8 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Fundc2Q9D6K8 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Fundc2Q9D6K8 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Fundc2Q9D6K8 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Fundc2Q9D6K8 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fundc2Q9D6K8 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Fundc2Q9D6K8 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Fundc2Q9D6K8 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Fundc2Q9D6K8 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Fundc2Q9D6K8 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Fundc2Q9D6K8 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Fundc2Q9D6K8 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms