Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5V5

Cul5, Cullin-5, mousemouse

Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul5Q9D5V5 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Cul5Q9D5V5 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Cul5Q9D5V5 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Cul5Q9D5V5 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Cul5Q9D5V5 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Cul5Q9D5V5 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Cul5Q9D5V5 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Cul5Q9D5V5 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Cul5Q9D5V5 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Cul5Q9D5V5 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Cul5Q9D5V5 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Cul5Q9D5V5 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Cul5Q9D5V5 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Cul5Q9D5V5 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Cul5Q9D5V5 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Cul5Q9D5V5 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Cul5Q9D5V5 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
Cul5Q9D5V5 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Cul5Q9D5V5 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Cul5Q9D5V5 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Cul5Q9D5V5 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Cul5Q9D5V5 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Cul5Q9D5V5 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Cul5Q9D5V5 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Cul5Q9D5V5 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Cul5Q9D5V5 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
Cul5Q9D5V5 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Cul5Q9D5V5 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Cul5Q9D5V5 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Cul5Q9D5V5 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
Cul5Q9D5V5 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Cul5Q9D5V5 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Cul5Q9D5V5 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
Cul5Q9D5V5 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Cul5Q9D5V5 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Cul5Q9D5V5 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Cul5Q9D5V5 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Cul5Q9D5V5 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Cul5Q9D5V5 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Cul5Q9D5V5 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Cul5Q9D5V5 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Cul5Q9D5V5 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Cul5Q9D5V5 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Cul5Q9D5V5 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Cul5Q9D5V5 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Cul5Q9D5V5 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Cul5Q9D5V5 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Cul5Q9D5V5 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Cul5Q9D5V5 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Cul5Q9D5V5 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Cul5Q9D5V5 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Cul5Q9D5V5 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Cul5Q9D5V5 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Cul5Q9D5V5 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Cul5Q9D5V5 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Cul5Q9D5V5 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
Cul5Q9D5V5 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Cul5Q9D5V5 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Cul5Q9D5V5 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Cul5Q9D5V5 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Cul5Q9D5V5 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Cul5Q9D5V5 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Cul5Q9D5V5 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Cul5Q9D5V5 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Cul5Q9D5V5 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Cul5Q9D5V5 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
Cul5Q9D5V5 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Cul5Q9D5V5 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Cul5Q9D5V5 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Cul5Q9D5V5 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Cul5Q9D5V5 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Cul5Q9D5V5 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Cul5Q9D5V5 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
Cul5Q9D5V5 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Cul5Q9D5V5 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Cul5Q9D5V5 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Cul5Q9D5V5 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Cul5Q9D5V5 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Cul5Q9D5V5 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Cul5Q9D5V5 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Cul5Q9D5V5 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Cul5Q9D5V5 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Cul5Q9D5V5 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Cul5Q9D5V5 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Cul5Q9D5V5 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Cul5Q9D5V5 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Cul5Q9D5V5 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Cul5Q9D5V5 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Cul5Q9D5V5 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Cul5Q9D5V5 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Cul5Q9D5V5 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Cul5Q9D5V5 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Cul5Q9D5V5 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Cul5Q9D5V5 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Cul5Q9D5V5 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Cul5Q9D5V5 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Cul5Q9D5V5 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Cul5Q9D5V5 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
Cul5Q9D5V5 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Cul5Q9D5V5 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 330.7 ms