Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4S4

4930564D02Rik, RIKEN cDNA 4930564D02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930564D02RikQ9D4S4 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
4930564D02RikQ9D4S4 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
4930564D02RikQ9D4S4 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
4930564D02RikQ9D4S4 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
4930564D02RikQ9D4S4 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
4930564D02RikQ9D4S4 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
4930564D02RikQ9D4S4 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
4930564D02RikQ9D4S4 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
4930564D02RikQ9D4S4 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
4930564D02RikQ9D4S4 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
4930564D02RikQ9D4S4 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
4930564D02RikQ9D4S4 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
4930564D02RikQ9D4S4 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
4930564D02RikQ9D4S4 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
4930564D02RikQ9D4S4 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
4930564D02RikQ9D4S4 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
4930564D02RikQ9D4S4 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
4930564D02RikQ9D4S4 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
4930564D02RikQ9D4S4 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
4930564D02RikQ9D4S4 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
4930564D02RikQ9D4S4 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
4930564D02RikQ9D4S4 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
4930564D02RikQ9D4S4 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
4930564D02RikQ9D4S4 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
4930564D02RikQ9D4S4 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
4930564D02RikQ9D4S4 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
4930564D02RikQ9D4S4 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
4930564D02RikQ9D4S4 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
4930564D02RikQ9D4S4 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
4930564D02RikQ9D4S4 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
4930564D02RikQ9D4S4 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
4930564D02RikQ9D4S4 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
4930564D02RikQ9D4S4 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
4930564D02RikQ9D4S4 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
4930564D02RikQ9D4S4 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
4930564D02RikQ9D4S4 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
4930564D02RikQ9D4S4 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
4930564D02RikQ9D4S4 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
4930564D02RikQ9D4S4 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
4930564D02RikQ9D4S4 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
4930564D02RikQ9D4S4 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
4930564D02RikQ9D4S4 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
4930564D02RikQ9D4S4 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
4930564D02RikQ9D4S4 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
4930564D02RikQ9D4S4 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
4930564D02RikQ9D4S4 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
4930564D02RikQ9D4S4 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
4930564D02RikQ9D4S4 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
4930564D02RikQ9D4S4 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
4930564D02RikQ9D4S4 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
4930564D02RikQ9D4S4 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
4930564D02RikQ9D4S4 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
4930564D02RikQ9D4S4 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
4930564D02RikQ9D4S4 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
4930564D02RikQ9D4S4 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
4930564D02RikQ9D4S4 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
4930564D02RikQ9D4S4 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
4930564D02RikQ9D4S4 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
4930564D02RikQ9D4S4 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
4930564D02RikQ9D4S4 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
4930564D02RikQ9D4S4 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
4930564D02RikQ9D4S4 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
4930564D02RikQ9D4S4 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
4930564D02RikQ9D4S4 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
4930564D02RikQ9D4S4 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
4930564D02RikQ9D4S4 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
4930564D02RikQ9D4S4 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
4930564D02RikQ9D4S4 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
4930564D02RikQ9D4S4 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
4930564D02RikQ9D4S4 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
4930564D02RikQ9D4S4 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
4930564D02RikQ9D4S4 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
4930564D02RikQ9D4S4 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
4930564D02RikQ9D4S4 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
4930564D02RikQ9D4S4 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
4930564D02RikQ9D4S4 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
4930564D02RikQ9D4S4 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
4930564D02RikQ9D4S4 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
4930564D02RikQ9D4S4 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
4930564D02RikQ9D4S4 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
4930564D02RikQ9D4S4 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
4930564D02RikQ9D4S4 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
4930564D02RikQ9D4S4 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
4930564D02RikQ9D4S4 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
4930564D02RikQ9D4S4 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
4930564D02RikQ9D4S4 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
4930564D02RikQ9D4S4 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
4930564D02RikQ9D4S4 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
4930564D02RikQ9D4S4 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
4930564D02RikQ9D4S4 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
4930564D02RikQ9D4S4 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
4930564D02RikQ9D4S4 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
4930564D02RikQ9D4S4 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
4930564D02RikQ9D4S4 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
4930564D02RikQ9D4S4 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
4930564D02RikQ9D4S4 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
4930564D02RikQ9D4S4 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
4930564D02RikQ9D4S4 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
4930564D02RikQ9D4S4 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
4930564D02RikQ9D4S4 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms