Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4Q1

Ribc2, RIB43A-like with coiled-coils protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ribc2Q9D4Q1 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ribc2Q9D4Q1 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ribc2Q9D4Q1 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ribc2Q9D4Q1 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ribc2Q9D4Q1 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ribc2Q9D4Q1 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ribc2Q9D4Q1 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ribc2Q9D4Q1 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ribc2Q9D4Q1 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ribc2Q9D4Q1 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ribc2Q9D4Q1 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ribc2Q9D4Q1 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ribc2Q9D4Q1 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ribc2Q9D4Q1 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Ribc2Q9D4Q1 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ribc2Q9D4Q1 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Ribc2Q9D4Q1 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ribc2Q9D4Q1 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ribc2Q9D4Q1 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ribc2Q9D4Q1 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ribc2Q9D4Q1 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ribc2Q9D4Q1 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ribc2Q9D4Q1 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ribc2Q9D4Q1 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ribc2Q9D4Q1 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ribc2Q9D4Q1 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ribc2Q9D4Q1 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ribc2Q9D4Q1 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ribc2Q9D4Q1 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ribc2Q9D4Q1 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ribc2Q9D4Q1 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Ribc2Q9D4Q1 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ribc2Q9D4Q1 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ribc2Q9D4Q1 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ribc2Q9D4Q1 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ribc2Q9D4Q1 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ribc2Q9D4Q1 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ribc2Q9D4Q1 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ribc2Q9D4Q1 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Ribc2Q9D4Q1 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ribc2Q9D4Q1 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ribc2Q9D4Q1 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ribc2Q9D4Q1 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ribc2Q9D4Q1 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ribc2Q9D4Q1 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ribc2Q9D4Q1 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ribc2Q9D4Q1 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ribc2Q9D4Q1 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ribc2Q9D4Q1 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ribc2Q9D4Q1 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ribc2Q9D4Q1 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ribc2Q9D4Q1 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ribc2Q9D4Q1 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ribc2Q9D4Q1 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ribc2Q9D4Q1 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ribc2Q9D4Q1 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ribc2Q9D4Q1 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ribc2Q9D4Q1 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ribc2Q9D4Q1 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ribc2Q9D4Q1 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ribc2Q9D4Q1 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ribc2Q9D4Q1 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ribc2Q9D4Q1 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Ribc2Q9D4Q1 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ribc2Q9D4Q1 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ribc2Q9D4Q1 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ribc2Q9D4Q1 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ribc2Q9D4Q1 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ribc2Q9D4Q1 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ribc2Q9D4Q1 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ribc2Q9D4Q1 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ribc2Q9D4Q1 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ribc2Q9D4Q1 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ribc2Q9D4Q1 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ribc2Q9D4Q1 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ribc2Q9D4Q1 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ribc2Q9D4Q1 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ribc2Q9D4Q1 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ribc2Q9D4Q1 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ribc2Q9D4Q1 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ribc2Q9D4Q1 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ribc2Q9D4Q1 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ribc2Q9D4Q1 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ribc2Q9D4Q1 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ribc2Q9D4Q1 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ribc2Q9D4Q1 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ribc2Q9D4Q1 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Ribc2Q9D4Q1 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ribc2Q9D4Q1 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ribc2Q9D4Q1 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Ribc2Q9D4Q1 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ribc2Q9D4Q1 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ribc2Q9D4Q1 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ribc2Q9D4Q1 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ribc2Q9D4Q1 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ribc2Q9D4Q1 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ribc2Q9D4Q1 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ribc2Q9D4Q1 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ribc2Q9D4Q1 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ribc2Q9D4Q1 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
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