Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3X3

4933428M09Rik, RIKEN cDNA 4933428M09 gene, mousemouse

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933428M09RikQ9D3X3 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
4933428M09RikQ9D3X3 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
4933428M09RikQ9D3X3 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
4933428M09RikQ9D3X3 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
4933428M09RikQ9D3X3 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
4933428M09RikQ9D3X3 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
4933428M09RikQ9D3X3 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
4933428M09RikQ9D3X3 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
4933428M09RikQ9D3X3 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
4933428M09RikQ9D3X3 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
4933428M09RikQ9D3X3 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
4933428M09RikQ9D3X3 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
4933428M09RikQ9D3X3 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
4933428M09RikQ9D3X3 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
4933428M09RikQ9D3X3 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
4933428M09RikQ9D3X3 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
4933428M09RikQ9D3X3 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
4933428M09RikQ9D3X3 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
4933428M09RikQ9D3X3 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
4933428M09RikQ9D3X3 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
4933428M09RikQ9D3X3 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
4933428M09RikQ9D3X3 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
4933428M09RikQ9D3X3 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
4933428M09RikQ9D3X3 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
4933428M09RikQ9D3X3 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
4933428M09RikQ9D3X3 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
4933428M09RikQ9D3X3 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
4933428M09RikQ9D3X3 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
4933428M09RikQ9D3X3 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
4933428M09RikQ9D3X3 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
4933428M09RikQ9D3X3 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
4933428M09RikQ9D3X3 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
4933428M09RikQ9D3X3 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
4933428M09RikQ9D3X3 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
4933428M09RikQ9D3X3 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
4933428M09RikQ9D3X3 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
4933428M09RikQ9D3X3 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
4933428M09RikQ9D3X3 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
4933428M09RikQ9D3X3 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
4933428M09RikQ9D3X3 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
4933428M09RikQ9D3X3 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
4933428M09RikQ9D3X3 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
4933428M09RikQ9D3X3 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
4933428M09RikQ9D3X3 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
4933428M09RikQ9D3X3 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
4933428M09RikQ9D3X3 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
4933428M09RikQ9D3X3 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
4933428M09RikQ9D3X3 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
4933428M09RikQ9D3X3 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
4933428M09RikQ9D3X3 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
4933428M09RikQ9D3X3 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
4933428M09RikQ9D3X3 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
4933428M09RikQ9D3X3 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
4933428M09RikQ9D3X3 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
4933428M09RikQ9D3X3 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
4933428M09RikQ9D3X3 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
4933428M09RikQ9D3X3 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
4933428M09RikQ9D3X3 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
4933428M09RikQ9D3X3 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
4933428M09RikQ9D3X3 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
4933428M09RikQ9D3X3 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
4933428M09RikQ9D3X3 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
4933428M09RikQ9D3X3 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
4933428M09RikQ9D3X3 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
4933428M09RikQ9D3X3 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
4933428M09RikQ9D3X3 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
4933428M09RikQ9D3X3 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
4933428M09RikQ9D3X3 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
4933428M09RikQ9D3X3 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
4933428M09RikQ9D3X3 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
4933428M09RikQ9D3X3 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
4933428M09RikQ9D3X3 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
4933428M09RikQ9D3X3 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
4933428M09RikQ9D3X3 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
4933428M09RikQ9D3X3 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
4933428M09RikQ9D3X3 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
4933428M09RikQ9D3X3 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
4933428M09RikQ9D3X3 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
4933428M09RikQ9D3X3 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
4933428M09RikQ9D3X3 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
4933428M09RikQ9D3X3 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
4933428M09RikQ9D3X3 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
4933428M09RikQ9D3X3 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
4933428M09RikQ9D3X3 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
4933428M09RikQ9D3X3 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
4933428M09RikQ9D3X3 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
4933428M09RikQ9D3X3 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
4933428M09RikQ9D3X3 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
4933428M09RikQ9D3X3 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
4933428M09RikQ9D3X3 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
4933428M09RikQ9D3X3 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
4933428M09RikQ9D3X3 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
4933428M09RikQ9D3X3 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
4933428M09RikQ9D3X3 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
4933428M09RikQ9D3X3 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
4933428M09RikQ9D3X3 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
4933428M09RikQ9D3X3 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
4933428M09RikQ9D3X3 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
4933428M09RikQ9D3X3 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
4933428M09RikQ9D3X3 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.8 ms