Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3W4

Gpn3, GPN-loop GTPase 3, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpn3Q9D3W4 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gpn3Q9D3W4 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gpn3Q9D3W4 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gpn3Q9D3W4 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gpn3Q9D3W4 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gpn3Q9D3W4 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gpn3Q9D3W4 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gpn3Q9D3W4 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Gpn3Q9D3W4 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gpn3Q9D3W4 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gpn3Q9D3W4 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gpn3Q9D3W4 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gpn3Q9D3W4 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gpn3Q9D3W4 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gpn3Q9D3W4 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gpn3Q9D3W4 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gpn3Q9D3W4 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Gpn3Q9D3W4 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gpn3Q9D3W4 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gpn3Q9D3W4 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gpn3Q9D3W4 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gpn3Q9D3W4 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gpn3Q9D3W4 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gpn3Q9D3W4 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gpn3Q9D3W4 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gpn3Q9D3W4 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gpn3Q9D3W4 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Gpn3Q9D3W4 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Gpn3Q9D3W4 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gpn3Q9D3W4 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gpn3Q9D3W4 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gpn3Q9D3W4 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gpn3Q9D3W4 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gpn3Q9D3W4 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gpn3Q9D3W4 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gpn3Q9D3W4 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gpn3Q9D3W4 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gpn3Q9D3W4 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gpn3Q9D3W4 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gpn3Q9D3W4 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gpn3Q9D3W4 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gpn3Q9D3W4 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gpn3Q9D3W4 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gpn3Q9D3W4 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gpn3Q9D3W4 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gpn3Q9D3W4 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gpn3Q9D3W4 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gpn3Q9D3W4 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gpn3Q9D3W4 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gpn3Q9D3W4 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gpn3Q9D3W4 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gpn3Q9D3W4 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gpn3Q9D3W4 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Gpn3Q9D3W4 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gpn3Q9D3W4 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gpn3Q9D3W4 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gpn3Q9D3W4 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gpn3Q9D3W4 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gpn3Q9D3W4 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gpn3Q9D3W4 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gpn3Q9D3W4 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gpn3Q9D3W4 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gpn3Q9D3W4 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gpn3Q9D3W4 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Gpn3Q9D3W4 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gpn3Q9D3W4 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gpn3Q9D3W4 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gpn3Q9D3W4 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gpn3Q9D3W4 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gpn3Q9D3W4 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gpn3Q9D3W4 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Gpn3Q9D3W4 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gpn3Q9D3W4 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gpn3Q9D3W4 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gpn3Q9D3W4 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Gpn3Q9D3W4 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gpn3Q9D3W4 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gpn3Q9D3W4 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gpn3Q9D3W4 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gpn3Q9D3W4 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gpn3Q9D3W4 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gpn3Q9D3W4 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gpn3Q9D3W4 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gpn3Q9D3W4 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gpn3Q9D3W4 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Gpn3Q9D3W4 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gpn3Q9D3W4 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gpn3Q9D3W4 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gpn3Q9D3W4 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gpn3Q9D3W4 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gpn3Q9D3W4 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gpn3Q9D3W4 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gpn3Q9D3W4 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gpn3Q9D3W4 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gpn3Q9D3W4 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gpn3Q9D3W4 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Gpn3Q9D3W4 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gpn3Q9D3W4 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gpn3Q9D3W4 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gpn3Q9D3W4 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms