Protein–RNA interactions for Protein: Q9D312

Krt20, Keratin, type I cytoskeletal 20, mousemouse

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt20Q9D312 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC26,1■■□□□ 1,77
Krt20Q9D312 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC26,1■■□□□ 1,77
Krt20Q9D312 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,09■■□□□ 1,77
Krt20Q9D312 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC26,09■■□□□ 1,77
Krt20Q9D312 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26,09■■□□□ 1,77
Krt20Q9D312 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26,08■■□□□ 1,77
Krt20Q9D312 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26,08■■□□□ 1,77
Krt20Q9D312 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,08■■□□□ 1,77
Krt20Q9D312 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC26,06■■□□□ 1,76
Krt20Q9D312 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,06■■□□□ 1,76
Krt20Q9D312 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC26,05■■□□□ 1,76
Krt20Q9D312 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26,04■■□□□ 1,76
Krt20Q9D312 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,02■■□□□ 1,76
Krt20Q9D312 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,01■■□□□ 1,75
Krt20Q9D312 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1,75
Krt20Q9D312 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,99■■□□□ 1,75
Krt20Q9D312 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,97■■□□□ 1,75
Krt20Q9D312 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25,96■■□□□ 1,75
Krt20Q9D312 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,96■■□□□ 1,75
Krt20Q9D312 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,94■■□□□ 1,74
Krt20Q9D312 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25,93■■□□□ 1,74
Krt20Q9D312 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,92■■□□□ 1,74
Krt20Q9D312 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,92■■□□□ 1,74
Krt20Q9D312 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,91■■□□□ 1,74
Krt20Q9D312 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25,91■■□□□ 1,74
Krt20Q9D312 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,91■■□□□ 1,74
Krt20Q9D312 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC25,89■■□□□ 1,74
Krt20Q9D312 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,89■■□□□ 1,73
Krt20Q9D312 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,88■■□□□ 1,73
Krt20Q9D312 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25,88■■□□□ 1,73
Krt20Q9D312 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,87■■□□□ 1,73
Krt20Q9D312 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,87■■□□□ 1,73
Krt20Q9D312 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC25,86■■□□□ 1,73
Krt20Q9D312 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC25,86■■□□□ 1,73
Krt20Q9D312 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25,85■■□□□ 1,73
Krt20Q9D312 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,85■■□□□ 1,73
Krt20Q9D312 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25,85■■□□□ 1,73
Krt20Q9D312 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25,85■■□□□ 1,73
Krt20Q9D312 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,85■■□□□ 1,73
Krt20Q9D312 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25,84■■□□□ 1,73
Krt20Q9D312 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,83■■□□□ 1,73
Krt20Q9D312 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC25,83■■□□□ 1,73
Krt20Q9D312 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,83■■□□□ 1,73
Krt20Q9D312 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25,82■■□□□ 1,72
Krt20Q9D312 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,81■■□□□ 1,72
Krt20Q9D312 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25,8■■□□□ 1,72
Krt20Q9D312 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25,8■■□□□ 1,72
Krt20Q9D312 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25,8■■□□□ 1,72
Krt20Q9D312 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC25,79■■□□□ 1,72
Krt20Q9D312 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,79■■□□□ 1,72
Krt20Q9D312 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25,78■■□□□ 1,72
Krt20Q9D312 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC25,78■■□□□ 1,72
Krt20Q9D312 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,78■■□□□ 1,72
Krt20Q9D312 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,78■■□□□ 1,72
Krt20Q9D312 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25,77■■□□□ 1,72
Krt20Q9D312 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,77■■□□□ 1,72
Krt20Q9D312 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,77■■□□□ 1,72
Krt20Q9D312 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,77■■□□□ 1,72
Krt20Q9D312 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25,77■■□□□ 1,72
Krt20Q9D312 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,76■■□□□ 1,71
Krt20Q9D312 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25,75■■□□□ 1,71
Krt20Q9D312 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25,74■■□□□ 1,71
Krt20Q9D312 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25,74■■□□□ 1,71
Krt20Q9D312 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25,74■■□□□ 1,71
Krt20Q9D312 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25,73■■□□□ 1,71
Krt20Q9D312 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,73■■□□□ 1,71
Krt20Q9D312 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25,72■■□□□ 1,71
Krt20Q9D312 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,71■■□□□ 1,71
Krt20Q9D312 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25,71■■□□□ 1,71
Krt20Q9D312 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25,7■■□□□ 1,7
Krt20Q9D312 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,7■■□□□ 1,7
Krt20Q9D312 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,7■■□□□ 1,7
Krt20Q9D312 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25,69■■□□□ 1,7
Krt20Q9D312 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,68■■□□□ 1,7
Krt20Q9D312 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,68■■□□□ 1,7
Krt20Q9D312 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,68■■□□□ 1,7
Krt20Q9D312 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,67■■□□□ 1,7
Krt20Q9D312 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,66■■□□□ 1,7
Krt20Q9D312 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,66■■□□□ 1,7
Krt20Q9D312 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,64■■□□□ 1,7
Krt20Q9D312 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC25,63■■□□□ 1,69
Krt20Q9D312 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,62■■□□□ 1,69
Krt20Q9D312 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25,62■■□□□ 1,69
Krt20Q9D312 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,6■■□□□ 1,69
Krt20Q9D312 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC25,59■■□□□ 1,69
Krt20Q9D312 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,59■■□□□ 1,69
Krt20Q9D312 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25,58■■□□□ 1,69
Krt20Q9D312 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25,58■■□□□ 1,68
Krt20Q9D312 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25,56■■□□□ 1,68
Krt20Q9D312 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,56■■□□□ 1,68
Krt20Q9D312 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC25,56■■□□□ 1,68
Krt20Q9D312 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25,56■■□□□ 1,68
Krt20Q9D312 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,54■■□□□ 1,68
Krt20Q9D312 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25,54■■□□□ 1,68
Krt20Q9D312 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC25,53■■□□□ 1,68
Krt20Q9D312 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25,52■■□□□ 1,68
Krt20Q9D312 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25,52■■□□□ 1,68
Krt20Q9D312 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,51■■□□□ 1,67
Krt20Q9D312 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25,5■■□□□ 1,67
Krt20Q9D312 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,49■■□□□ 1,67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10,2 ms