Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2T6

1700034E13Rik, RIKEN cDNA 1700034E13 gene, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700034E13RikQ9D2T6 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
1700034E13RikQ9D2T6 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
1700034E13RikQ9D2T6 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
1700034E13RikQ9D2T6 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
1700034E13RikQ9D2T6 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
1700034E13RikQ9D2T6 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
1700034E13RikQ9D2T6 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
1700034E13RikQ9D2T6 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
1700034E13RikQ9D2T6 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
1700034E13RikQ9D2T6 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
1700034E13RikQ9D2T6 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
1700034E13RikQ9D2T6 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
1700034E13RikQ9D2T6 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
1700034E13RikQ9D2T6 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
1700034E13RikQ9D2T6 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
1700034E13RikQ9D2T6 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
1700034E13RikQ9D2T6 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
1700034E13RikQ9D2T6 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
1700034E13RikQ9D2T6 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
1700034E13RikQ9D2T6 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
1700034E13RikQ9D2T6 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
1700034E13RikQ9D2T6 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
1700034E13RikQ9D2T6 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
1700034E13RikQ9D2T6 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
1700034E13RikQ9D2T6 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
1700034E13RikQ9D2T6 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
1700034E13RikQ9D2T6 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
1700034E13RikQ9D2T6 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
1700034E13RikQ9D2T6 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
1700034E13RikQ9D2T6 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
1700034E13RikQ9D2T6 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
1700034E13RikQ9D2T6 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
1700034E13RikQ9D2T6 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
1700034E13RikQ9D2T6 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
1700034E13RikQ9D2T6 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
1700034E13RikQ9D2T6 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
1700034E13RikQ9D2T6 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
1700034E13RikQ9D2T6 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
1700034E13RikQ9D2T6 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
1700034E13RikQ9D2T6 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
1700034E13RikQ9D2T6 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
1700034E13RikQ9D2T6 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
1700034E13RikQ9D2T6 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
1700034E13RikQ9D2T6 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
1700034E13RikQ9D2T6 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
1700034E13RikQ9D2T6 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
1700034E13RikQ9D2T6 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
1700034E13RikQ9D2T6 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
1700034E13RikQ9D2T6 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
1700034E13RikQ9D2T6 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
1700034E13RikQ9D2T6 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
1700034E13RikQ9D2T6 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
1700034E13RikQ9D2T6 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
1700034E13RikQ9D2T6 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
1700034E13RikQ9D2T6 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
1700034E13RikQ9D2T6 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
1700034E13RikQ9D2T6 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
1700034E13RikQ9D2T6 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
1700034E13RikQ9D2T6 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
1700034E13RikQ9D2T6 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
1700034E13RikQ9D2T6 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
1700034E13RikQ9D2T6 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
1700034E13RikQ9D2T6 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
1700034E13RikQ9D2T6 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
1700034E13RikQ9D2T6 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
1700034E13RikQ9D2T6 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
1700034E13RikQ9D2T6 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
1700034E13RikQ9D2T6 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
1700034E13RikQ9D2T6 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
1700034E13RikQ9D2T6 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
1700034E13RikQ9D2T6 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
1700034E13RikQ9D2T6 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
1700034E13RikQ9D2T6 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
1700034E13RikQ9D2T6 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
1700034E13RikQ9D2T6 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
1700034E13RikQ9D2T6 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
1700034E13RikQ9D2T6 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
1700034E13RikQ9D2T6 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
1700034E13RikQ9D2T6 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
1700034E13RikQ9D2T6 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
1700034E13RikQ9D2T6 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
1700034E13RikQ9D2T6 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
1700034E13RikQ9D2T6 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
1700034E13RikQ9D2T6 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
1700034E13RikQ9D2T6 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
1700034E13RikQ9D2T6 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
1700034E13RikQ9D2T6 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
1700034E13RikQ9D2T6 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
1700034E13RikQ9D2T6 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
1700034E13RikQ9D2T6 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
1700034E13RikQ9D2T6 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
1700034E13RikQ9D2T6 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
1700034E13RikQ9D2T6 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
1700034E13RikQ9D2T6 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
1700034E13RikQ9D2T6 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
1700034E13RikQ9D2T6 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
1700034E13RikQ9D2T6 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
1700034E13RikQ9D2T6 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
1700034E13RikQ9D2T6 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
1700034E13RikQ9D2T6 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms