Protein–RNA interactions for Protein: Q9D187

Fam96b, Mitotic spindle-associated MMXD complex subunit MIP18, mousemouse

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Length 163 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam96bQ9D187 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fam96bQ9D187 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fam96bQ9D187 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fam96bQ9D187 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Fam96bQ9D187 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Fam96bQ9D187 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Fam96bQ9D187 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Fam96bQ9D187 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Fam96bQ9D187 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Fam96bQ9D187 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fam96bQ9D187 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fam96bQ9D187 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fam96bQ9D187 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fam96bQ9D187 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fam96bQ9D187 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fam96bQ9D187 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fam96bQ9D187 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fam96bQ9D187 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fam96bQ9D187 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fam96bQ9D187 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fam96bQ9D187 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fam96bQ9D187 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fam96bQ9D187 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fam96bQ9D187 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fam96bQ9D187 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fam96bQ9D187 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fam96bQ9D187 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fam96bQ9D187 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Fam96bQ9D187 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Fam96bQ9D187 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Fam96bQ9D187 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Fam96bQ9D187 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fam96bQ9D187 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fam96bQ9D187 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fam96bQ9D187 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fam96bQ9D187 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fam96bQ9D187 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fam96bQ9D187 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fam96bQ9D187 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fam96bQ9D187 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fam96bQ9D187 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fam96bQ9D187 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fam96bQ9D187 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fam96bQ9D187 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fam96bQ9D187 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fam96bQ9D187 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fam96bQ9D187 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fam96bQ9D187 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fam96bQ9D187 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Fam96bQ9D187 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fam96bQ9D187 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Fam96bQ9D187 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Fam96bQ9D187 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Fam96bQ9D187 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fam96bQ9D187 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fam96bQ9D187 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fam96bQ9D187 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fam96bQ9D187 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fam96bQ9D187 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fam96bQ9D187 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fam96bQ9D187 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fam96bQ9D187 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fam96bQ9D187 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fam96bQ9D187 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fam96bQ9D187 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fam96bQ9D187 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fam96bQ9D187 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fam96bQ9D187 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Fam96bQ9D187 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fam96bQ9D187 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Fam96bQ9D187 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Fam96bQ9D187 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Fam96bQ9D187 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Fam96bQ9D187 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Fam96bQ9D187 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Fam96bQ9D187 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Fam96bQ9D187 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Fam96bQ9D187 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Fam96bQ9D187 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Fam96bQ9D187 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Fam96bQ9D187 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Fam96bQ9D187 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Fam96bQ9D187 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Fam96bQ9D187 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Fam96bQ9D187 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Fam96bQ9D187 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Fam96bQ9D187 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Fam96bQ9D187 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Fam96bQ9D187 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Fam96bQ9D187 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Fam96bQ9D187 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Fam96bQ9D187 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Fam96bQ9D187 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fam96bQ9D187 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fam96bQ9D187 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Fam96bQ9D187 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Fam96bQ9D187 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Fam96bQ9D187 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Fam96bQ9D187 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Fam96bQ9D187 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.2 ms